python - 使用gdcm(草根DICOM)解压DICOM图像数据

Question

是否可以使用 GDCM 的 Python 包装器解码 DICOM 文件中的图像数据？

我有一个字节数组/字符串，其中包含DICOM文件中图像数据的字节(即标签的内容>7fe0,0010(“像素数据”))，我想将图像解码为原始 RGB 或灰度。

我正在想一些事情 the lines of this但仅使用图像数据，而不是实际 DICOM 文件本身的路径。

Answer 1

您可以阅读示例，其中一个示例展示了如何获取输入的压缩 DICOM 并将其转换为未压缩的。请在此处查看在线代码:

• Decompress Image

如果您是 NumPy 的忠实粉丝，请查看:

• This module add support for converting a gdcm.Image to a numpy array.

这是一个低级示例，展示了如何检索图像的实际原始缓冲区。

处理Transfer Syntax转换的更好的类是使用gdcm.ImageChangeTransferSyntax类(允许解压缩图标)

• gdcm::ImageChangeTransferSyntax Class Reference

如果您不介意阅读一点 C++，您可以轻松地将以下代码从 C++ 转换为 Python:

• Compress Image

请注意，此示例实际上是压缩图像，而不是解压缩图像。

最后，如果您确实只能访问 Pixel Data 属性中包含的数据值，那么您确实应该看看(C# 语法应该接近 Python 语法):

• Decompress JPEG File

此示例显示如何解压缩 JPEG 无损、非分层、一阶预测文件。 JPEG 数据是从文件中读取的，但如果该数据已在您的情况的内存中，则它应该可以工作。