python - 使用父类调用方法

Question

我对面向对象编程非常陌生，并且很难理解如何管理具有相关数据的类之间的关系。

我正在尝试表示一系列生物体的一些基因组信息，我最终将对其进行比较。所以我有一个 Species 类:

class Species(object):
    def __init__(self, species_name, genes={}, contigs={}):
        self.species_name = species_name
        self.genes = genes
        self.contigs = contigs

那么我想要一个 Gene 类，

class Gene(object):
    def __init__(self, locus_tag, annotation, dna_seq, aa_seq):
        self.locus_tag = locus_tag
        self.annotation = annotation
        self.dna_seq = dna_seq
        self.aa_seq = aa_seq

这个想法是，Species 的 genes 方法将是 Gene 对象的字典，其中键是 locus_tag 基因的。我想我知道如何实现这一部分。

但我希望能够做的一件事是在 Gene 对象上调用一个函数，该函数需要知道它所在的 Species (它将输出包含 species_name 和 locus_tag 的文件结构，但它们来自两个不同的类。我能想到的最简单的方法是添加 species_name 直接到 Gene 类，但由于每个 Gene 将位于 Species 中，这似乎是多余的。

我什至不知道从哪里开始 - 我做了很多搜索，但我发现的其他问题要么不相关，要么我不够理解以掌握相关性。

Answer 1

创建 Gene 对象，然后通过传递 genes 字典来创建 Species 对象，然后更新 Gene code> 对象，通过为其设置 Species 实例，如下所示:

for gene in genes:
    gene.species = species

之后，每个 Gene 实例 (gene) 都可以通过执行 self.species 来引用其 Species 对象或者，例如，self.species.species_name 来获取名称。