python - 将 pandas 数据表传输到文本文件

Question

我有一个示例数据集:

import pandas as pd

df = {'ID': ['>H97', '>H80','>H85','>H91','>H91094'],
      'Sequence': ['GGAGTCGG','GAGGCTTAGTCCAG','GAAGCCTTCGGAGA', 'CTGTGCAGCCT', 'GCCTGGTCCAGCCT']}


df = pd.DataFrame(df)

数据集如下所示:

>>> df
        ID        Sequence
0     >H97        GGAGTCGG
1     >H80        GAGGCTTAGTCCAG
2     >H85        GAAGCCTTCGGAGA
3     >H91        CTGTGCAGCCT
4     >H91094     GCCTGGTCCAGCCT

我想写入输出 .txt 文件，使该文件看起来像:

>H97 
GGAGTCGG
>H80
GAGGCTTAGTCCAG
>H85        
GAAGCCTTCGGAGA
>H91        
CTGTGCAGCCT
>H91094
GCCTGGTCCAGCCT

Answer 1

您可以使用\n作为分隔符:

df.to_csv("test.txt", header=False, index=False, sep = "\n")

输出:

>H97
GGAGTCGG
>H80
GAGGCTTAGTCCAG
>H85
GAAGCCTTCGGAGA
>H91
CTGTGCAGCCT
>H91094
GCCTGGTCCAGCCT