python - 在python中显示带有附加变量的组中的唯一名称和列值总计

Question

我正在学习 Python，并且认为从事项目工作可能是学习它的最佳方式。我有大约 200,000 行数据，其中数据显示患者的药物列表。这是数据示例。

PTID PTNAME     MME   DRNAME       DRUGNAME                    SPLY STR QTY  FACTOR
1   PATIENT, A  2700    DR, A   OXYCODONE HCL 15 MG             30  15  120 1.5
1   PATIENT, A  2700    DR, B   OXYCODONE HCL 15 MG             30  15  120 1.5
2   PATIENT, B  4050    DR, C   MORPHINE SULFATE ER 15 MG       30  15  270 1
2   PATIENT, B  4050    DR, C   MORPHINE SULFATE ER 15 MG       30  15  270 1
2   PATIENT, B   840    DR, A   OXYCODONE-ACETAMINOPHE 10MG-32  14  10  56  1.5
2   PATIENT, B  1350    DR, C   OXYCODONE-ACETAMINOPHE 5 MG-32  15  5   180 1.5
3   PATIENT, C  1350    DR, C   OXYCODONE-ACETAMINOPHE 5 MG-32  15  5   180 1.5
3   PATIENT, C  1800    DR, D   OXYCODONE-ACETAMINOPHE 10MG-32  30  10  120 1.5

我一直在思考这个问题，并尝试了很多方法，但没有一个代码产生任何结果或没有任何意义。老实说，我什至不知道从哪里开始。如果有一点帮助，我们将不胜感激。

因此，我想要做的是整合每个患者的数据并计算每个患者的总 MME。 DRUGNAME 应显示具有更高 MME 的药物。换句话说，数据帧对于每个患者应该只有一行。

我尝试过的一件事是

groupby_ptname = semp.groupby('PTNAME').apply(lambda x: x.MME.sum())

它显示了具有总 MME 的独特患者姓名，但我不确定如何在这个新数据框中添加其他变量。

Answer 1

IIUC 你可以这样做:

In [62]: df.sort_values('MME').groupby('PTNAME').agg({'MME':'sum', 'DRUGNAME':'last'})
Out[62]:
                                  DRUGNAME    MME
PTNAME
PATIENT, A             OXYCODONE HCL 15 MG   5400
PATIENT, B       MORPHINE SULFATE ER 15 MG  10290
PATIENT, C  OXYCODONE-ACETAMINOPHE 10MG-32   3150

或使用.reset_index():

In [64]: df.sort_values('MME').groupby('PTNAME').agg({'MME':'sum', 'DRUGNAME':'last'}).reset_index()
Out[64]:
       PTNAME                        DRUGNAME    MME
0  PATIENT, A             OXYCODONE HCL 15 MG   5400
1  PATIENT, B       MORPHINE SULFATE ER 15 MG  10290
2  PATIENT, C  OXYCODONE-ACETAMINOPHE 10MG-32   3150

更新:使用agg()函数更有趣

In [84]: agg_funcs = {
    ...:     'MME':{'MME_max':'last',
    ...:            'MME_total':'sum'},
    ...:     'DRUGNAME':{'DRUGNAME_max_MME':'last'}
    ...: }
    ...:
    ...: rslt = (df.sort_values('MME')
    ...:          .groupby('PTNAME')
    ...:          .agg(agg_funcs)
    ...:          .reset_index()
    ...: )
    ...: rslt.columns = [tup[1] if tup[1] else tup[0] for tup in rslt.columns]
    ...:

In [85]: rslt
Out[85]:
       PTNAME  MME_total  MME_max                DRUGNAME_max_MME
0  PATIENT, A       5400     2700             OXYCODONE HCL 15 MG
1  PATIENT, B      10290     4050       MORPHINE SULFATE ER 15 MG
2  PATIENT, C       3150     1800  OXYCODONE-ACETAMINOPHE 10MG-32