从大栅格层随机抽样

Question

我有一个很大的 Rasterlayer，其整数范围从 0 到 44。

class       : RasterLayer
dimensions  : 29800, 34470, 1027206000  (nrow, ncol, ncell)
resolution  : 10, 10  (x, y)
extent      : 331300, 676000, 5681995, 5979995  (xmin, xmax, ymin, ymax)
coord. ref. : +proj=utm +zone=32 +ellps=GRS80 +units=m +no_defs
data source : /home/mkoehler/stk_rast_whz
names       : stk_rast_whz
values      : 0, 44  (min, max)

我想进行每层 5000 个点的分层抽样。我收到以下错误:

POINTS<-sampleStratified(b, size=5000, na.rm=T, xy=F)
(Error in ys[[i]] <- y : attempt to select less than one element)

这是重现问题的代码(即使只选择 1每层项目):

 set.seed(10)
 r <- raster(ncol=5000, nrow=5000)
 names(r) <- 'stratum'
 r[] <- round((runif(ncell(r)))*44)

 sampleStratified(r, size=1,xy=T)

Error in ys[[i]] <- y : attempt to select less than one element

尝试使用较少的层并更改“大小”的设置或“exp”无效。R 版本:[64 位] C:\Program Files\R\R-3.1.1

有什么想法吗？

提前致谢!

Answer 1

这似乎是一个错误(如 raster 2.3-12)，并且在 (1) 您的栅格包含值为 0 的像元时发生。 , (2) 栅格无法在内存中处理(即 canProcessInMemory(r) 是 FALSE )。

该函数遍历 freq(r) 生成的唯一单元格值, 然后依次按这些值中的每一个索引列表。如果这些值之一为零，则会触发错误，因为第 0 个元素不存在。例如:

list()[[0]]
# Error in list()[[0]] : attempt to select less than one element]

您会注意到，如果您填写 r，则不会发生错误例如，r[] <- sample(44, ncell(r), replace=TRUE) ，因为它不会有任何零。

当栅格可以在内存中处理时，函数循环遍历 freq(r) 的行号。 , 因此后续的列表索引是明智的。

我已联系维护人员报告此错误。

与此同时，作为临时修复，您可以使用类似下面的内容来制作函数的更正副本(它将在当前 R session 中保持可用)。

sampleStratified2 <- 
  eval(parse(text=sub('sr\\[, 2\\] == i', 'sr[, 2] == f[i, 1]',
                      sub('i in f\\[, 1\\]', 'i in seq_len(nrow(f))',
                          deparse(getMethod(sampleStratified, 
                                            signature='RasterLayer')@.Data))
  )))

sampleStratified2(r, size=1, xy=TRUE)