R - gplots - 当 key=FALSE 时删除 heatmap.2 中的空白

Question

我有:

library(gplots);
x<-matrix(seq(1:100),nrow=10,byrow=TRUE);
heatmap.2(x, Rowv=NA, Colv=NA, scale="none", main="This title will be cut off by the white space where the non-existant key is supposed to go.", col=gray((255:0)/255), dendrogram="none",trace="none", key=FALSE);

当键被指定为 FALSE 时，图左侧有一块空白，阻止显示完整标题，与手动指定较小的边距相冲突，并将热图向右移动。空白的宽度可以使用 "keysize=#" 控制，但使其太小(介于 0.8 和 1.0 之间)会产生错误: "Error in plot.new() : figure margins too large"
我会尝试用 heatmap() 来做这件事而不是 heatmap.2() ，但热图在 par() 上效果不佳我需要一个项目。如果有人有任何建议，我将不胜感激。

Answer 1

可以使用布局参数来定位 heatmap.2 图的元素。

layout(mat = lmat, widths = lwid, heights = lhei)

我使用以下方法得到了一个非常可接受的热图。

heatmap.2(x, 
    Rowv=NA, 
    Colv=NA, 
    scale="none", 
    main="This title will be cut off by the white space where the non-existant key is supposed to go.", 
    col=gray((255:0)/255), 
    dendrogram="none",
    trace="none", 
    key=FALSE, 
    lmat=rbind(c(2),c(3),c(1),c(4)), 
    lhei=c(1,1,9,0), 
    lwid=c(1)
    );

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