python - 消除一维阵列中的 Blob / Blob

Question

我有一个一维 NumPy 数组，其中包含一些“坏”值。我想剔除它们。

每个坏值的邻居只是“顽皮”，但我也想剔除它们。

对不良值的可靠测试是询问:

arr<0.1

但是，(我能想到的)对于顽皮值的唯一可靠测试是它与坏值相邻。

我使用以下策略来消除不良和顽皮的值(value)观:

import numpy as np

c     = np.random.random(100) #Construct test data

who = np.where(c<0.1)[0]      #Reliable test for bad values
c[who] = 0                    #Zero bad values
#Add and subtract from the indices of the bad values to cull
#their neighbours
wht = who-1; wht = wht[np.logical_and(0<wht,wht<len(c))]; c[wht]=0
wht = who+1; wht = wht[np.logical_and(0<wht,wht<len(c))]; c[wht]=0
wht = who+2; wht = wht[np.logical_and(0<wht,wht<len(c))]; c[wht]=0
wht = who-2; wht = wht[np.logical_and(0<wht,wht<len(c))]; c[wht]=0

不幸的是，上述速度相当慢。

是否有更快的方法来执行此操作或类似的操作？

Answer 1

针对邻居的通用窗口长度的一种可扩展解决方案是 binary-dilate阈值比较的掩码，然后使用该掩码设置零 -

from scipy.ndimage.morphology import binary_dilation

W = 2 # window length of neighbors
thresh = 0.1
mask = c < thresh
kernel = np.ones(2*W+1)
mask_extended = binary_dilation(mask, kernel)
c[mask_extended] = 0