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我试图将 ete3.Tree
的所有功能继承到名为 TreeAugmented
的新类中,但并非所有方法和属性都可用?
我应该在 __init__
中使用 super
做些什么吗?似乎使用 super
您必须指定单个属性,如 The inheritance of attributes using __init__ 中所示.
我可以在名为 tree
的类中拥有另一个对象,其中存储 ete3.Tree
中的所有内容,但我希望能够将这些对象与ete3
包。
有没有办法从父类继承所有内容?
import ete3
newick = "(((petal_width:0.098798,petal_length:0.098798):0.334371,"
"sepal_length:0.433169):1.171322,sepal_width:1.604490);"
print(ete3.Tree(newick).children)
# [Tree node '' (0x1296bf40), Tree node 'sepal_width' (0x1296bf0f)]
class TreeAugmented(ete3.Tree):
def __init__(self, name=None, new_attribute=None):
self.name = name # This is an attribute in ete3 namespace
self.new_attribute = new_attribute
x = TreeAugmented(newick)
x.children
回溯
AttributeError Traceback (most recent call last)
<ipython-input-76-de3016b5fd1b> in <module>()
9
10 x = TreeAugmented(newick)
---> 11 x.children
~/anaconda/envs/python3/lib/python3.6/site-packages/ete3/coretype/tree.py in _get_children(self)
145
146 def _get_children(self):
--> 147 return self._children
148 def _set_children(self, value):
149 if type(value) == list and \
AttributeError: 'TreeAugmented' object has no attribute '_children'
最佳答案
Is there a way to just inherit everything from the parent class?
默认情况下就是这种情况。子类继承它不重写的内容。
你的 child 类(class)几乎是正确的。由于您重写了 __init__
方法,因此您需要确保也调用父类的 __init__
方法。
这是使用super
实现的:
class TreeAugmented(ete3.Tree):
def __init__(self, newick=None, name=None, format=0, dist=None, support=None, new_attribute=None):
super().__init__(newick=newick, format=format, dist=dist, support=support, name=name)
self.new_attribute = new_attribute
不需要执行self.name = name
,因为它是在super().__init__()
中完成的。您所需要关心的只是您 child 类(class)的具体情况。
此外,由于您没有触及所有这些父 init 属性,因此可以使用 args/kwargs 使代码更清晰:
class TreeAugmented(ete3.Tree):
def __init__(self, newick=None, new_attribute=None, *args, **kwargs):
super().__init__(newick=newick, *args, **kwargs)
self.new_attribute = new_attribute
在此示例中,我将 newick
保留为第一个位置,并决定所有其他参数都在 new_attribute
之后,或者是关键字参数。
如果您不愿意,则不必公开父类的所有参数。例如,如果您想创建一个仅执行 format 3 "all branches + all names" 操作的子类,您可以通过编写强制格式:
class TreeAugmented(ete3.Tree):
def __init__(self, newick=None, name=None, dist=None, support=None, new_attribute=None):
super().__init__(newick=newick, format=3, dist=dist, support=support, name=name)
self.new_attribute = new_attribute
(这只是一个展示常见做法的虚拟示例。它在您的上下文中可能没有意义。)
关于python - 如何继承父类的所有功能?,我们在Stack Overflow上找到一个类似的问题: https://stackoverflow.com/questions/50995225/
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