r - 在 R 中开发包时清除以前版本的函数

Question

我正在用 R 开发一个包。我们称之为 mypkg .

因为某些函数在从包中运行时表现不同(我不确定为什么——但这不是问题)，我正在编辑包中的函数，然后从命令行重建包。出于某种原因，给定的 R 实例保留了旧版本的函数，即使源已更改并且包已重建和重新安装。我需要启动一个新实例才能看到更改。

这是典型的工作流程。

更改 myfunction()在 mypkg.R

在 R 中:detach(package:mypkg); remove.packages("mypkg")

命令行:R CMD INSTALL --build c:\mypkg

通知我它已经安装到默认库

在 R 中:library(mypkg)

在 R 中:myfunction()在更改之前运行以前的版本。

[我想避免的接下来的三个步骤]

启动一个新的 R 实例

在 R 中:library(mypkg)

myfunction()按预期工作

在 R.2.14.1 下运行。

我正在寻找有关如何改进此工作流程以避免启动新 R 实例的建议。

Answer 1

您需要尝试卸载包裹以及分离它。 ?detach已:

If a package has a namespace, detaching it does not by default unload the namespace (and may not even with ‘unload=TRUE’), and detaching will not in general unload any dynamically loaded compiled code (DLLs). Further, registered S3 methods from the namespace will not be removed. If you use ‘library’ on a package whose namespace is loaded, it attaches the exports of the already loaded namespace. So detaching and re-attaching a package may not refresh some or all components of the package, and is inadvisable.

特别注意最后一句话。

尝试:

detach(package:mypkg, unload = TRUE)

请注意，“如果包具有命名空间”现在表示所有包，因为这在 R 2.14.0 中已更改(IIRC 版本号)

如果您要更改的代码是 R 代码，请考虑使用 assignInNamespace()将全局工作区中的对象/函数(即 mypkg 中的函数的较新版本)分配给 mypkg 的命名空间.例如我们有函数 foo()在 mypkg在本地我们有 newfoo()这是 foo()的较新版本:

assignInNamespace("foo", newfoo, "mypkg")

如果更改与 C 代码相关，或者上述内容不起作用，那么也许您应该遵循 R Core 的建议并生成一个新的 R 实例，而不是尝试分离您的包。

另见 开发工具 如果你说 Emacs，Hadley Wickham 和 Emacs+ESS 的包可能会使开发过程更容易(产生新的 R 实例等)。