unix - 如何从匹配文件 2 的文件 1 中提取内容并将它们按文件 2 的顺序排列

Question

我有 file1.txt内容:

rs002
rs113
rs209
rs227
rs151 
rs104

我有 file2.txt内容:

rs113   113
rs002   002
rs227   227
rs209   209
rs104   104
rs151   151

我想得到 file2.txt 的行匹配 file1.txt 中的记录，为此我尝试过:

grep -Fwf file1.txt file2.txt 

输出如下:

rs113   113
rs002   002
rs227   227
rs209   209
rs104   104
rs151   151

这将提取所有匹配的行，但它是按照 file2.txt 中的出现顺序进行的。 .有什么方法可以在保持来自 file1.txt的顺序的同时提取匹配的记录吗？ ?所需的输出如下:

rs002   002
rs113   113
rs209   209
rs227   227
rs151   151
rs104   104

Answer 1

一种(当然不是很优雅)解决方案是循环遍历 file1.txt并为每一行寻找匹配项:

while IFS= read -r line; do
    grep -wF "$line" file2.txt
done < file1.txt

这给出了输出

rs002   002
rs113   113
rs209   209
rs227   227
rs151   151
rs104   104

如果您知道每行最多只出现一次，则可以通过告诉 grep 在第一次匹配后停止来加快速度:

grep -m 1 -wF "$line" file2.txt

据我所知，这是一个 GNU 扩展。

请注意，在每个循环中循环一个文件以对另一个文件进行一些处理通常是 sign that there is a much more efficient way to do things ，所以这可能只应用于足够小的文件，在这种情况下，提出更好的解决方案比使用此解决方案处理它们花费的时间更长。