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我不确定这个标题是否适合我的情况:我想分享 numpy array 的原因是它可能是我的情况的潜在解决方案之一,但如果您有其他解决方案,也可以不错。
我的任务:我需要使用多处理实现一个迭代算法,而每个进程都需要有一份数据副本(这个数据很大,并且< strong>只读,并且在迭代算法过程中不会改变)。
我编写了一些伪代码来演示我的想法:
import multiprocessing
def worker_func(data, args):
# do sth...
return res
def compute(data, process_num, niter):
data
result = []
args = init()
for iter in range(niter):
args_chunk = split_args(args, process_num)
pool = multiprocessing.Pool()
for i in range(process_num):
result.append(pool.apply_async(worker_func,(data, args_chunk[i])))
pool.close()
pool.join()
# aggregate result and update args
for res in result:
args = update_args(res.get())
if __name__ == "__main__":
compute(data, 4, 100)
问题是在每次迭代中,我都必须将数据传递给子进程,这非常耗时。
我想出了两种可能的解决方案:
那么,有没有办法在进程之间共享只读 numpy 数组?或者,如果您很好地实现了解决方案 2,它也可以工作。
提前致谢。
最佳答案
如果您绝对必须使用 Python 多处理,那么您可以将 Python 多处理与 Arrow's Plasma object store 一起使用。将对象存储在共享内存中并从每个工作人员访问它。请参阅this example ,它使用 Pandas 数据框而不是 numpy 数组执行相同的操作。
如果您不是绝对需要使用 Python 多重处理,则可以使用 Ray 更轻松地完成此操作。 。 Ray 的优点之一是它不仅可以开箱即用地处理数组,还可以处理包含数组的 Python 对象。
在底层,Ray 使用 Apache Arrow 序列化 Python 对象,这是一个零拷贝数据布局,并将结果存储在 Arrow's Plasma object store 中。这允许工作任务对对象具有只读访问权限,而无需创建自己的副本。您可以阅读更多关于 how this works .
这是运行示例的修改版本。
import numpy as np
import ray
ray.init()
@ray.remote
def worker_func(data, i):
# Do work. This function will have read-only access to
# the data array.
return 0
data = np.zeros(10**7)
# Store the large array in shared memory once so that it can be accessed
# by the worker tasks without creating copies.
data_id = ray.put(data)
# Run worker_func 10 times in parallel. This will not create any copies
# of the array. The tasks will run in separate processes.
result_ids = []
for i in range(10):
result_ids.append(worker_func.remote(data_id, i))
# Get the results.
results = ray.get(result_ids)
请注意,如果我们省略了 data_id = ray.put(data)
行,而是调用 worker_func.remote(data, i)
,则 data
数组将在每次函数调用时存储在共享内存中一次,这是低效的。通过首先调用 ray.put,我们可以将对象一次性存储在对象存储中。
关于python3多进程共享numpy数组(只读),我们在Stack Overflow上找到一个类似的问题: https://stackoverflow.com/questions/54580947/
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