python - 如何计算输出文件(写入 txt 文件的字符串列表)中的字母 N？

Question

已解决

我需要能够计算输出文件中所有字符串中“N”的数量。但当我打印结果时，我总是得到 0 或 None。有人看到我的代码中的错误吗？

def ncount(filename):
    count = 0
    with open(filename, 'r') as file:
        for words in file:
            if words in file == "N":
                count = count + 1
                return count
count = ncount("output_seq.txt")
print(count)

输出文件如下所示:

["GATTTTCTATGACATCTAGAAGAAAAAGAAAGACTATAAGATGTATAAAAACAAGAGGNNCNGAGAAAATCGAGACAGGTGGTGAGAATCTGCCGAATTAN", 
"AACATTGCTGAGAGGTTCGATCGTGATCCCTGCAAGAAAAAATAAAGGTGGAGATGATNNCNCAATGTATGTTGTCTCGTCACACTGGTTTAATGATTTTN", 
"CTTTTTTTTAAATATTTCGGGCGGTAATTTTTTCTGCCATCTTTTTCACTAAGAAAACTTTCAGGCGTTGTTAAGCGGTGGAATCTATAGAGCTGTCTCTT", 
"ATGTATCTAACGAGACAGCAATGGGAATTTTGTATTAAAAAAAAGAAGAAATACATATTTTGAAACAGGAATGTTGTTTGATTTTTAAAGAAAAAAGGAAA", 
"TCCAGACGCAAAANNNNNNNNTTTTTGTCTCAAGACTACAGTACCCTGGGTCTCGCCACGAAAATTGTTTGTTAAATGAGAAAATGTGTGCGCCTTTAAAG", 
""]

这是一个虚拟文件，仅包含 5 个序列。实际文件包含数千个这样的字符串

我不断收到的输出是:

0

Answer 1

使用file.readlines()将文件作为字符串逐行迭代。然后，您可以简单地使用 count() 方法来计算字符串中术语的出现次数:

def ncount(filename):
    count = 0
    with open(filename, 'r') as myfile:
        for line in myfile.readlines():
            count += line.count('N')
    return count
count = ncount("somefile.txt")
print(count)

对于您的"output_seq.txt" 文件，此输出为16。