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我想将三个类别的核密度图放在一个图和垂直线中,以指示整个分布的均值和中值。使用 ggplot2
绘图相当容易,但我一直在努力使传奇正确,这非常非常困难。
set.seed(1234)
data <- data.frame(value = rgamma(n = 10000, shape = 3, scale = 1),
type = sample(letters[1:3], size = 10000, replace = TRUE))
data$value[data$type == "b"] <- data$value[data$type == "b"] +
rnorm(sum(data$type == "b"), mean = 2)
data$value[data$type == "c"] <- data$value[data$type == "c"] +
rnorm(sum(data$type == "c"), mean = 4)
# Let's produce a 'coloured' AND 'filled' density plot
# ('cause I want both the area under the curve and the line to be coloured)
library(ggplot2)
gp <- ggplot(data=data, aes_string(x="value"))
gp <- gp + geom_density(aes_string(fill="type", colour="type"), alpha=0.3)
gp
# Now let's add vertical lines to the plot, indicating the mean
# and median for the whole distribution
vlines <- data.frame(mean_median = c(mean(data$value), median(data$value)),
labels = c("Mean", "Median"))
gp <- gp + geom_vline(data=vlines,
aes(xintercept=mean_median, colour=labels),
size=1.05, linetype="dashed", show_guide=TRUE)
gp
vlines
以及“彩色”和“填充”密度。我确实想要两个图例,其中一个是 vlines 的图例(两个条目),另一个是密度图颜色的图例。
geom_density
要么着色要么填充,但不能两者兼而有之。它工作得更好,但这不是我想要的(因为我想要密度图的面积和线都具有颜色)。它是这样的。而不是这样做:
gp <- gp + geom_density(aes_string(fill="type", colour="type"), alpha=0.3)
gp <- gp + geom_density(aes_string(fill="type"), alpha=0.3)
show_guide
解决。几何体,因为您可以覆盖是否为单个几何体绘制图例。我玩过它,但它在我的情况下不起作用,因为我需要来自两个几何体(密度和 vlines)的图例,问题是在其中一个几何体中同时具有填充和颜色,以及另一个几何体中的颜色。
最佳答案
很可能是一种更简单的方法来做到这一点,但您可以破解绘图对象,作为上述评论的替代方法。你可以做两个情节,一个是你喜欢的情节,一个是你喜欢的图例,然后交换图例。
# Plot with density area and line coloured but legend not right
p1 <- ggplot(data=data, aes(x=value)) +
geom_density(aes(fill=type, colour=type), alpha=0.3 ) +
geom_vline(data=vlines, aes(xintercept=mean_median, colour=labels),
linetype="dashed", size=1.5, show_guide=TRUE )
g1 <- ggplotGrob(p1)
# Plot with density line not coloured but legend is ok
p2 <- ggplot(data=data, aes(x=value)) +
geom_density(aes(fill=type), alpha=0.3 ) +
geom_vline(data=vlines, aes(xintercept=mean_median, colour=labels),
linetype="dashed", size=1.5, show_guide=TRUE ) +
guides(fill = guide_legend(override.aes = list(linetype = 0 )))
g2 <- ggplotGrob(p2)
# Add legend of second plot to first plot
g1$grobs[which(g1$layout$name=="guide-box")] <-
g2$grobs[which(g2$layout$name=="guide-box")]
grid::grid.newpage()
grid::grid.draw(g1)
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