r - 将列添加到 sqlite 数据库

Question

我正在尝试将我在 R 中生成的向量作为新列添加到 sqlite 表中。为此，我想使用 dplyr (我根据这篇文章 here 安装了最新的开发版本以及 dbplyr 包)。我试过的:

library(dplyr)
library(DBI) 

#creating initial database and table
dbcon      <- dbConnect(RSQLite::SQLite(), "cars.db") 
dbWriteTable(dbcon, name = "cars", value = cars)
cars_tbl <- dplyr::tbl(dbcon, "cars")

#new values which I want to add as a new column 
new_values <- sample(c("A","B","C"), nrow(cars), replace = TRUE) 

#attempt to add new values as column to the table in the database
cars_tbl %>% mutate(new_col = new_values) #not working

实现这一目标的简单方法是什么(不一定使用 dplyr)？

Answer 1

不知道这样做的方法 dyplr ，但您可以使用 RSQLite 来实现直接地。问题实际上不在于 RSQLite ，但事实上我不知道如何将列表传递给 mutate .请注意，在您的代码中，这样的事情会起作用:

cars_tbl %>% mutate(new_col = another_column / 3.14)

无论如何，我的选择。我创造了一个玩具 cars数据框。

cars <- data.frame(year=c(1999, 2007, 2009, 2017), model=c("Ford", "Toyota", "Toyota", "BMW"))

我打开连接并实际创建表，

dbcon <- dbConnect(RSQLite::SQLite(), "cars.db")
dbWriteTable(dbcon, name = "cars", value = cars)

添加新列并检查，

dbGetQuery(dbcon, "ALTER TABLE cars ADD COLUMN new_col TEXT")
dbGetQuery(dbcon, "SELECT * FROM cars")
  year  model new_col
1 1999   Ford    <NA>
2 2007 Toyota    <NA>
3 2009 Toyota    <NA>
4 2017    BMW    <NA>

然后您可以更新新列，但唯一棘手的是您必须提供 where声明，在这种情况下，我使用年份。

new_values <- sample(c("A","B","C"), nrow(cars), replace = TRUE) 
new_values
[1] "C" "B" "B" "B"

dbGetPreparedQuery(dbcon, "UPDATE cars SET new_col = ? where year=?",
                   bind.data=data.frame(new_col=new_values,
                                        year=cars$year))

dbGetQuery(dbcon, "SELECT * FROM cars")
  year  model new_col
1 1999   Ford       C
2 2007 Toyota       B
3 2009 Toyota       B
4 2017    BMW       B

作为唯一索引，您始终可以使用 rownames(cars) ，但您必须将其添加为数据框中的列，然后添加到表中。

根据@krlmlr 的建议进行编辑: 使用 dbExecute 确实好多了而不是弃用 dbGetPreparedQuery ,

dbExecute(dbcon, "UPDATE cars SET new_col = :new_col where year = :year",
          params=data.frame(new_col=new_values,
                            year=cars$year))

评论后编辑 : 前几天没想过这个，不过就算是 SQLite您可以使用 rowid .我已经测试过这个并且它有效。

dbExecute(dbcon, "UPDATE cars SET new_col = :new_col where rowid = :id",
          params=data.frame(new_col=new_values,
                            id=rownames(cars)))

尽管您必须确保表中的 rowid 与您的 rownames 相同。无论如何，您始终可以像这样获得 rowid:

dbGetQuery(dbcon, "SELECT rowid, * FROM cars")
  rowid year  model new_col
1     1 1999   Ford       C
2     2 2007 Toyota       B
3     3 2009 Toyota       B
4     4 2017    BMW       B