javascript - Bokeh 中的自定义 javascript 回调可从数据框中选择列并更新绘图

Question

我有一个 Excel 工作表，其中包含 20 多个元素(每个元素是一列)随时间(运行)的浓度。

我必须根据每个元素的平均值和标准差绘制浓度与时间的关系图。

我想制作一个 Bokeh 程序，让我选择要查看的元素并相应地更新绘图。我不想为了让它工作而必须连接到服务器，我希望它是一个独立的 html。所以，我知道我需要编写一个自定义 js 回调来执行此操作。

我的代码现在的工作方式是，我有一个函数来计算平均值和标准差，将其存储在新的 df 中，并使用该 df 来绘制图形。

这是我到目前为止的代码。现在它的编码方式使其仅显示一个元素

import pandas as pd
import os
from bokeh.plotting import figure, output_file, show
from bokeh.models import ColumnDataSource, HoverTool,CustomJS
from bokeh.models.widgets import Select
from bokeh.layouts import row, column

def get_data(low,element):
    mean=low[element].mean()
    plus_three_sigma=mean+(low[element].std()*3)
    minus_three_sigma=mean-(low[element].std()*3)
    plus_two_sigma=mean+(low[element].std()*2)
    minus_two_sigma=mean-(low[element].std()*2)
    df=pd.DataFrame({"Run":low["run"],element:low[element],"mean":mean,"plus_three_sigma":plus_three_sigma,"minus_three_sigma":minus_three_sigma,"plus_two_sigma":plus_two_sigma,"minus_two_sigma":minus_two_sigma})
    return df
def make_plot(df):
    tips=[("Run", "@Run"),("Concentration", "$y")]
    source=ColumnDataSource(df)
    p = figure(plot_width=1300, plot_height=800, x_range=df["Run"], tooltips=tips, title="QC Low", x_axis_label="Run ID",y_axis_label="Concentration ng/mL")
    p.line(x="Run", y="mean", line_width=1, color="black", source=source)
    p.line(x="Run", y="plus_three_sigma", line_width=1, color="red", source=source)
    p.line(x="Run", y="minus_three_sigma", line_width=1, color="red", source=source)
    p.line(x="Run", y="minus_two_sigma", line_width=1, color="green",line_dash="dashed",source=source)
    p.line(x="Run", y="plus_two_sigma", line_width=1, color="green",line_dash="dashed",source=source)
    pc=p.circle(x='Run', y="9Be",source=source)
    p.xaxis.major_label_orientation = 1.2
    return p

#callback = CustomJS(args=, code="""
#
#    }
#    source.change.emit();
#""")
#---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------    

os.chdir(r'')


low=pd.read_excel(r"", sheet_name="QC LOW", skiprows=5, usecols=range(0,34))
low["run"]=low["run"].astype(str)
low.loc[~(low["run"].str.contains("A")) & ~(low["run"].str.contains("B")),"run"]=pd.to_datetime(low.loc[(~low["run"].str.contains("A")) & (~low["run"].str.contains("B")),"run"]).dt.strftime('%m/%d/%y')
cols=low.columns.tolist()
cols=cols[2:]

select = Select(title="Option:", value="9Be", options=cols)

output_file("output.html")

df=get_data(low,"9Be")
p=make_plot(df)
#select.js_on_change('value', callback)

show(row(select,p))

我不明白如何编写 JavaScript 回调来更新数据和绘图。我需要将 get_data 移至 java 脚本回调中吗？我不应该在函数中制作图形吗？我将如何编写 javascript 来完成我想要的事情。

Answer 1

因此，有几件事需要改变，并且有不止一种方法可以做到这一点，但这就是我一直让它发挥作用的方式。

1)你的 df 应该是一个字典，根据你的情况不同的元素进行分组。像这样的事情:

df2 = df.groupby('Element', sort = False).apply(lambda x: x.to_dict(orient = 'list'))

2)您的columndatasource将仅指向该字典中的第一个键。

source = ColumnDataSource(data = df2[0])

3)您选择的值应该是 df2 的键(换句话说，每个元素)

opts = [*df2.keys()]
select = Select(value = opts[0], options = opts)

4) 你的 JS 看起来像这样:

callback = CustomJS(args = dict(graph=source, source= df2.to_dict()), code =
            """                
            graph.data = source[cb_obj.value];
            graph.change.emit();
            """)

graph 是您的列数据源，graph.data 是您的第一个元素data。您的 cb_obj.value 将是您通过 select 选择的选项，并将充当源 (df2.to_dict) 的关键，以提取正确选择的数据。换句话说，当您在“选择”下拉菜单中选择一个元素时，您将用新选择的元素交换数据。

终于让它显示了:

select.js_on_change('value', callback)
layout = column(select, p)
show(layout)