python - 有没有一个Python函数可以丢弃或忽略负值？

Question

该程序应该找到字符串的开始位置(在“ATG”处)并切片直到终点(在“TAG”、“TAA”或“TGA”处)。每当我尝试使用我创建的函数和提供的测试字符串计算lastIndex时，我都会不断收到-1作为索引。是否有一个 Python 函数可以丢弃或忽略负值？

genome = 'TTATGTTTTAAGGATGGGGCGTTAGTT'
newGenome = ''

def firstIndex(genome):
    return genome.find("ATG")

def lastIndex(genome):
    return min(genome.find("TAG"), genome.find("TAA"), genome.find("TGA"))


for i in range(genome.count("ATG")):
    newgenome = genome[firstIndex(genome):lastIndex(genome)]

Answer 1

如果没有找到任何内容，

find 将返回 -1。因此，如果未找到任何密码子，您的 lastIndex 函数将始终返回 -1。

您并不是真的想“忽略-1”，而是想找到 TAG|TAA|TGA 的第一个实例。 (幸运的是，您提供了代码，因此我们避开了 XY problem 中最糟糕的部分)

您的代码还存在效率低下的问题 - 它必须对整个字符串进行 3 次完整遍历才能找到三个密码子之一的第一次出现。我们可以通过使用正则表达式来改进这一点。

尝试使用re.finditer，这样您只需通过基因组一次:

next(m.start() for m in re.finditer('TAG|TAA|TGA',genome))
Out[9]: 8

使用 next 很好，因为如果生成器表达式没有产生任何结果，我们可以提供默认值:

def lastIndex(genome):
    return next((m.start() for m in re.finditer('TAG|TAA|TGA',genome)),None)