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我有一个二维函数,我想计算网格点上函数的元素,但行和列上的两个循环非常慢,我想使用多处理
来增加代码的速度。我编写了以下代码来执行两个循环:
from multiprocessing import Pool
#Grid points
ra = np.linspace(25.1446, 25.7329, 1000)
dec = np.linspace(-10.477, -9.889, 1000)
#The 2D function
def like2d(x,y):
stuff=[RaDec, beta, rho_c_over_sigma_c, zhalo, rho_crit]
m=3e14
c=7.455
param=[x, y, m, c]
return reduced_shear( param, stuff, observed_g, g_err)
pool = Pool(processes=12)
def data_stream(a, b):
for i, av in enumerate(a):
for j, bv in enumerate(b):
yield (i, j), (av, bv)
def myfunc(args):
return args[0], like2d(*args[1])
counter,likelihood = pool.map(myfunc, data_stream(ra, dec))
但是我收到以下错误消息:
进程 PoolWorker-1:
Traceback (most recent call last):
File "/user/anaconda/lib/python2.7/multiprocessing/process.py", line 258, in _bootstrap
self.run()
File "/user/anaconda/lib/python2.7/multiprocessing/process.py", line 114, in run
self._target(*self._args, **self._kwargs)
File "/user/anaconda/lib/python2.7/multiprocessing/pool.py", line 102, in worker
task = get()
File "/user/anaconda/lib/python2.7/multiprocessing/queues.py", line 376, in get
return recv()
AttributeError: 'module' object has no attribute 'myfunc'
Process PoolWorker-2:
Traceback (most recent call last):
File "/user/anaconda/lib/python2.7/multiprocessing/process.py", line 258, in _bootstrap
self.run()
File "/user/anaconda/lib/python2.7/multiprocessing/process.py", line 114, in run
self._target(*self._args, **self._kwargs)
File "/user/anaconda/lib/python2.7/multiprocessing/pool.py", line 102, in worker
task = get()
File "/user/anaconda/lib/python2.7/multiprocessing/queues.py", line 376, in get
return recv()
AttributeError: 'module' object has no attribute 'myfunc'
Process PoolWorker-3:
Traceback (most recent call last):
File "/user/anaconda/lib/python2.7/multiprocessing/process.py", line 258, in _bootstrap
self.run()
File "/user/anaconda/lib/python2.7/multiprocessing/process.py", line 114, in run
self._target(*self._args, **self._kwargs)
File "/user/anaconda/lib/python2.7/multiprocessing/pool.py", line 102, in worker
task = get()
File "/user/anaconda/lib/python2.7/multiprocessing/queues.py", line 376, in get
return recv()
AttributeError: 'module' object has no attribute 'myfunc'
Process PoolWorker-4:
一切都已定义,我不明白为什么会出现此错误消息!谁能指出可能出了什么问题吗?
使用多处理
进行循环并将结果保存在二维数组中的另一种方法:
#Grid points
ra = np.linspace(25.1446, 25.7329, 1000)
dec = np.linspace(-10.477, -9.889, 1000)
#The 2D function
def like2d(x,y):
stuff=[RaDec, beta, rho_c_over_sigma_c, zhalo, rho_crit]
m=3e14
c=7.455
param=[x, y, m, c]
return reduced_shear( param, stuff, observed_g, g_err)
shared_array_base = multiprocessing.Array(ctypes.c_double, ra.shape[0]*dec.shape[0])
shared_array = np.ctypeslib.as_array(shared_array_base.get_obj())
shared_array = shared_array.reshape( ra.shape[0],dec.shape[0])
# Parallel processing
def my_func(i, def_param=shared_array):
shared_array[i,:] = np.array([float(like2d(ra[j],dec[i])) for j in range(ra.shape[0])])
print "processing to estimate likelihood in 2D grids......!!!"
start = time.time()
pool = multiprocessing.Pool(processes=12)
pool.map(my_func, range(dec.shape[0]))
print shared_array
end = time.time()
print end - start
最佳答案
您必须创建Pool
在辅助函数 ( myfunc
) 定义之后。创建Pool
导致 Python 在此时 fork 您的工作进程,并且子进程中唯一定义的内容是 Pool
上面定义的函数。定义。另外,map
将返回一个元组列表(每个对象 yield
由 data_stream
编辑),而不是单个元组。所以你需要这个:
from multiprocessing import Pool
#Grid points
ra = np.linspace(25.1446, 25.7329, 1000)
dec = np.linspace(-10.477, -9.889, 1000)
#The 2D function
def like2d(x,y):
stuff=[RaDec, beta, rho_c_over_sigma_c, zhalo, rho_crit]
m=3e14
c=7.455
param=[x, y, m, c]
return reduced_shear( param, stuff, observed_g, g_err)
def data_stream(a, b):
for i, av in enumerate(a):
for j, bv in enumerate(b):
yield (i, j), (av, bv)
def myfunc(args):
return args[0], like2d(*args[1])
if __name__ == "__main__":
pool = Pool(processes=12)
results = pool.map(myfunc, data_stream(ra, dec)) # results is a list of tuples.
for counter,likelihood in results:
print("counter: {}, likelihood: {}".format(counter, likelihood))
我添加了if __name__ == "__main__":
Guard,这在 POSIX 平台上不是必需的,但在 Windows 上是必需的(它不支持 os.fork()
)。
关于python - 二维函数网格点的多重处理,我们在Stack Overflow上找到一个类似的问题: https://stackoverflow.com/questions/25223794/
C语言sscanf()函数:从字符串中读取指定格式的数据 头文件: ?
最近,我有一个关于工作预评估的问题,即使查询了每个功能的工作原理,我也不知道如何解决。这是一个伪代码。 下面是一个名为foo()的函数,该函数将被传递一个值并返回一个值。如果将以下值传递给foo函数,
CStr 函数 返回表达式,该表达式已被转换为 String 子类型的 Variant。 CStr(expression) expression 参数是任意有效的表达式。 说明 通常,可以
CSng 函数 返回表达式,该表达式已被转换为 Single 子类型的 Variant。 CSng(expression) expression 参数是任意有效的表达式。 说明 通常,可
CreateObject 函数 创建并返回对 Automation 对象的引用。 CreateObject(servername.typename [, location]) 参数 serv
Cos 函数 返回某个角的余弦值。 Cos(number) number 参数可以是任何将某个角表示为弧度的有效数值表达式。 说明 Cos 函数取某个角并返回直角三角形两边的比值。此比值是
CLng 函数 返回表达式,此表达式已被转换为 Long 子类型的 Variant。 CLng(expression) expression 参数是任意有效的表达式。 说明 通常,您可以使
CInt 函数 返回表达式,此表达式已被转换为 Integer 子类型的 Variant。 CInt(expression) expression 参数是任意有效的表达式。 说明 通常,可
Chr 函数 返回与指定的 ANSI 字符代码相对应的字符。 Chr(charcode) charcode 参数是可以标识字符的数字。 说明 从 0 到 31 的数字表示标准的不可打印的
CDbl 函数 返回表达式,此表达式已被转换为 Double 子类型的 Variant。 CDbl(expression) expression 参数是任意有效的表达式。 说明 通常,您可
CDate 函数 返回表达式,此表达式已被转换为 Date 子类型的 Variant。 CDate(date) date 参数是任意有效的日期表达式。 说明 IsDate 函数用于判断 d
CCur 函数 返回表达式,此表达式已被转换为 Currency 子类型的 Variant。 CCur(expression) expression 参数是任意有效的表达式。 说明 通常,
CByte 函数 返回表达式,此表达式已被转换为 Byte 子类型的 Variant。 CByte(expression) expression 参数是任意有效的表达式。 说明 通常,可以
CBool 函数 返回表达式,此表达式已转换为 Boolean 子类型的 Variant。 CBool(expression) expression 是任意有效的表达式。 说明 如果 ex
Atn 函数 返回数值的反正切值。 Atn(number) number 参数可以是任意有效的数值表达式。 说明 Atn 函数计算直角三角形两个边的比值 (number) 并返回对应角的弧
Asc 函数 返回与字符串的第一个字母对应的 ANSI 字符代码。 Asc(string) string 参数是任意有效的字符串表达式。如果 string 参数未包含字符,则将发生运行时错误。
Array 函数 返回包含数组的 Variant。 Array(arglist) arglist 参数是赋给包含在 Variant 中的数组元素的值的列表(用逗号分隔)。如果没有指定此参数,则
Abs 函数 返回数字的绝对值。 Abs(number) number 参数可以是任意有效的数值表达式。如果 number 包含 Null,则返回 Null;如果是未初始化变量,则返回 0。
FormatPercent 函数 返回表达式,此表达式已被格式化为尾随有 % 符号的百分比(乘以 100 )。 FormatPercent(expression[,NumDigitsAfterD
FormatNumber 函数 返回表达式,此表达式已被格式化为数值。 FormatNumber( expression [,NumDigitsAfterDecimal [,Inc
我是一名优秀的程序员,十分优秀!