mysql - 试图使RmySQL工作，但不了解bash的导出或文件系统约定

Question

我试图在我的mac（小牛）上安装RMySQL，当我尝试从源代码构建它时，它出错了，并说：


  配置错误：找不到MySQL安装包括
  和/或库目录。手动指定
  MySQL库和头文件并重新运行R CMD INSTALL。
  
  说明：
  
  
  定义并导出2个外壳变量PKG_CPPFLAGS和PKG_LIBS，以包括头文件（* .h）和
  库，例如（使用Bourne shell语法）：
  
  出口PKG_CPPFLAGS =“-I”
    export PKG_LIBS =“-L -lmysqlclient”
     重新运行R INSTALL命令：
  
  R CMD安装RMySQL_.tar.gz
  


我尝试通过输入以下内容来遵循说明：


  导出PKG_CPPFLAGS =“-I / usr / local / mysql / include”导出
  PKG_LIBS =“-L / usr / local / mysql / lib -lmysqlclient”


但是当我重新运行RMySQL时，它仍然不起作用。而且，如果我键入


  $ PKG_LIBS


看看那个变量的含义，我得到


  -bash：-L / usr / local / mysql / lib：没有这样的文件或目录'


我知道/ usr / local / mysql / lib存在，并且确实包含mySQL标头。我会误解说明吗？

我只是在努力寻找解决方案和/或解决方法之后才在这里问。有时会很新手。

Answer 1

我要假设您正在尝试让RmySQL在Mavericks的R 3.1.0上运行？不必担心导出变量等问题，这里有一个简单的干净解决方案，可以避免麻烦。

上面提供的RMySQL install link Pascal确实是您的解决方案。您可能只是在语法上绊脚石，或是从终端上正常工作。

即使您是“菜鸟”，您也应该能够使用它。我将尝试在此处提供“虚拟指南”，因为我敢打赌，即使尝试阅读RMySQL安装自述文件，也有许多其他人也有此问题。

我敢肯定地说，问题是您没有正确指定要编译的库和头文件的位置。当您尝试编译时，请仔细阅读错误...错误可能会告诉您文件/标题丢失，或某些.so文件（共享对象）丢失。

一种简单的方法可以从R 3.1.0的源码（特立独行的）上编译RMySQL，如下所示（这不需要您设置任何环境变量，无需编辑Renviron文件等）：


MySQL本身可以工作吗？即您可以打开/运行它吗？如果没有，请先解决。
找到您的mysql安装的确切位置。对我来说，在Mavericks上，我看到mysql安装在/usr/local/mysql-5.6.17-osx10.7-x86_64（您的版本号可能不同）。还有另一个文件夹/ usr / local / mysql，它是/usr/local/mysql-5.6.17-osx10.7-x86_64的别名（如果/ usr / local / mysql找到当前使用的mysql版本，我认为存在多个mysql文件文件夹）。在此目录中，我看到两个子目录（其中有许多）称为“ include”和“ lib”。看一看; “ include”将包含头文件（在简单的C ++程序中，包含在#include等文件中）。 “ lib”文件夹包含mysql库的已编译源代码。
编译和安装RMySQL的一种简单方法并不完全遵循安装指南中建议的方法。请注意，这与安装指南中的操作相同，只是稍稍简单一点，因为它是从终端发出的一个命令行，一旦您知道mysql安装文件夹在哪里。转到终端，然后键入以下内容，在每个块之间留一个空格（并根据版本号对mysql文件夹名称进行适当调整）：


PKG_CPPFLAGS =“-I / usr / local / mysql / include /” PKG_LIBS =“-L / usr / local / mysql / lib / -lmysqlclient” R CMD安装RMySQL_0.9-3.tar.gz

或（同一件事，只需输入更多内容）

PKG_CPPFLAGS =“-I / usr / local / mysql-5.6.17-osx10.7-x86_64 / include /” PKG_LIBS =“-L / usr / local / mysql-5.6.17-osx10.7-x86_64 / lib /- lmysqlclient” R CMD安装RMySQL_0.9-3.tar.gz

假人注意事项：确保在运行此命令时，正在从包含RMySQL_0.9-3.tar.gz文件的目录中的终端（或包含RMySQL源代码的任何文件夹名称）中进行操作码）

和RMySQL编译！

不要担心尝试编译源代码-这不仅限于“编译语言程序员”或“计算机科学专业的毕业生”。多数情况下，编译失败是因为文件“丢失”（源代码没有损坏）－用户没有正确指定头文件和库（共享对象）的位置。现在拉起你的大男孩/女孩内裤，然后就开始做..这很容易。

那些不懂R的软件包编译源代码的人的注释：

a）请特别注意上面的间距，否则可能无法正常工作。 =和变量/文件名之间不能有空格（例如，不要尝试在上面的PKG_CPPFLAGS =“-I / usr / local / mysql / include /”中使用它，因为它将无法正常工作）

b）编译时，您要指定头文件和库文件的位置，这就是“ -I / ....”和“ -L / ....”的作用。 -I目录指定头文件的位置，-L目录指定库文件的位置。库文件还需要-l [库名]扩展名（库对象名称中的-l是-lib的缩写）。

c）请注意，在目录/usr/local/mysql-5.6.17-osx10.7-x86_64/lib/中，我看不到名为“ lmysqlclient”甚至“ libmysqlclient”的文件，但我确实看到了名为（其中包括“ libmysqlclient.a”和“ libmysqlclient.18.dylib”。因此，如果您在lib文件夹中看不到名为“ libmysqlclient”的文件，则不必担心您的MySQL安装不正确。