python - 自动执行 C 脚本以处理多个文件

Question

我目前正在使用您可以在此站点上找到的可下载脚本: http://mbio-serv2.mbioekol.lu.se/ARAGORN/

这是一个“.c”脚本，我使用 CodeBlocks 将其转换为“.o”。默认情况下，该脚本分析单个输入文件并提供另一个结果。

我想让这个脚本适用于大量输入文件，所以我需要一些自动化。因此，我需要创建另一个脚本来打开所有输入文件所在的目录，然后在每个输入文件上执行“.o”。

因此，我将为每个输入文件获取一个输出文件。

我想它一定是这样的:

open /.directory

i=0 

while 

(i < 'number of files to analyze') do {
    execute script.o (file i) > outputfilei.txt 
#save result for every input file
    i++
}

我对编程很陌生，所以我不知道如何处理这个问题。任何语言都可以，但我想我宁愿使用Python，因为我曾经在终端上运行它的脚本(我使用的是Mac)。

感谢您的时间和正手帮助。

Answer 1

您尚未指定如何保​​存多次运行的输出，但假设您希望将其全部保存在 stdout 上(因为 C 程序默认会打印它)，那么您最好的选择实际上是 shell 脚本(在 Python 中，做同样的事情会需要更多的工作):

#!/bin/bash
for file ; do ./aragorn (add your options here) $i ; done

现在，如果您将其另存为 aragorn_many (并使其可执行)，您可以像这样运行它:

./aragorn_many file1 file2 file3 ...

(假设编译后的 C 语言和 shell 脚本都在当前目录中)