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我实际上创建了一个 Javascript 来获取我组装的基因组的统计图:这是我的 Javascript 的名称:myscript.html
首先，我必须将我的 assembly.fa 文件转换为 JSON 格式的对象:
perl asm2stats.pl genome_assembly.fa > myoutput.json
那么，github中给出的用法是:
usage
最简单的绘图需要目标 div、装配跨度、ACGT 碱基计数、GC 百分比和脚手架长度数组，但是最好使用描述的 asm2stats.pl/asm2stats.minmaxgc.pl perl 脚本上面生成更丰富的预处理输入格式。有关使用预装箱数据的完整示例，请参阅 Danaus_plexippus_v3.assembly-stats.json 文件，基本用法详述如下:
<div id="assembly_stats">
<script>
d3.json("Danaus_plexippus_v3.assembly-stats.json", function(error, json) {
if (error) return console.warn(error);
asm = new Assembly (json);
asm.drawPlot('assembly_stats');
})
</script>
然后我写道:
<html>
<head>
<title>assembly stats</title>
</head>
<body>
<link rel="stylesheet" type="text/css" href="css/circle-plot.css">
<link rel="stylesheet" type="text/css" href="css/square-plot.css">
<link rel="stylesheet" type="text/css" href="css/table.css">
<script src="https://ajax.googleapis.com/ajax/libs/jquery/1.12.2/jquery.min.js"></script>
<script src="https://d3js.org/d3.v3.min.js" charset="utf-8"></script>
<script src="http://labratrevenge.com/d3-tip/javascripts/d3.tip.v0.6.3.js"></script>
<script type="text/javascript" src="js/circle-plot.js"></script>
<script type="text/javascript" src="js/square-plot.js"></script>
<script type="text/javascript" src="js/table.js"></script>
<div id="assembly_stats">
<div class="my_class"></div>
<script>
d3.json("output_0035.json", function(error, json) {
if (error) return console.warn(error);
asm = new Assembly (json);
asm.drawPlot('assembly_stats');
asm.drawTable('my_class');
asm.toggleVisible(['asm-longest_pie','asm-count']);
})
</script>
</body>
</html>
当我尝试在我的浏览器中运行它时，我只得到圆形图，但我也应该像 github 示例中那样得到表格表示。
我不太熟悉 html 代码，如果我忘记了代码中的某些内容以获取此代码，有人可以告诉我吗？这是手册:github感谢您的帮助:)
最佳答案
在body里面添加一个div元素，并给它一个class属性:
<div class="my-class-name"></div>
之后
asm.drawPlot('assembly_stats');
创建表
asm.drawTable('my-class-name');
关于javascript - 我的 Javascript 中的问题，我们在Stack Overflow上找到一个类似的问题： https://stackoverflow.com/questions/50325506/
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