尝试编译 HPCC 基准测试时无法链接到 BLAS/ATLAS

Question

我正在尝试在小型 RHEL 桌面上编译 HPCC 基准测试。在链接之前一切似乎都很好。我的链接命令是

    mpicc -DAdd_ -DF77_INTEGER=int -DStringSunStyle  -I../../../include \
 -I../../../include/myarch -I/path/to/my/ATLAS_build/include \
-I/usr/include/openmpi-x86_64 -fomit-frame-pointer -O3 -funroll-loops \
-W -Wall -lm -o ../../../../hpcc ../../../lib/bugzilla/libhpl.a \
/path/to/my/ATLAS_build/lib/libcblas.a \
/path/to/my/ATLAS_build/lib/libatlas.a -L/usr/lib64/openmpi/lib

链接失败并出现多个错误，所有错误都与链接器找不到的 BLAS/ATLAS 对象有关。其中一些是:

../../../lib/myarch/libhpl.a(HPL_dcopy.o): In function `HPL_dcopy':
HPL_dcopy.c:(.text+0x1e): undefined reference to `dcopy_'
../../../lib/myarch/libhpl.a(HPL_daxpy.o): In function `HPL_daxpy':
HPL_daxpy.c:(.text+0x2f): undefined reference to `daxpy_'
../../../lib/myarch/libhpl.a(HPL_dscal.o): In function `HPL_dscal':
HPL_dscal.c:(.text+0x22): undefined reference to `dscal_'
../../../lib/myarch/libhpl.a(HPL_idamax.o): In function `HPL_idamax':
HPL_idamax.c:(.text+0x1a): undefined reference to `idamax_'
../../../lib/myarch/libhpl.a(HPL_dgemv.o): In function `HPL_dgemv':
HPL_dgemv.c:(.text+0xba): undefined reference to `dgemv_'
HPL_dgemv.c:(.text+0x136): undefined reference to `dgemv_'

这就是我真正不明白的地方。以dgemv为例。 libhpl.a 确实调用了它:

>$ nm libhpl.a | grep dgemv
HPL_dgemv.o:
                 U dgemv_

现在，libcblas.a 已引用它，但需要 ATLAS 中的版本:

>$ nm libcblas.a | grep dgemv
cblas_dgemv.o:
                 U ATL_dgemv

最后，ATLAS有ATL_dgemv吗？

ATL_dgemv.o:
0000000000000000 T ATL_dgemv

所以，是的，确实如此。因此，CBLAS 有一个 dgemv，HPCC 应该(我认为)能够插入，但它需要 ATL_dgemv >。但 ATLAS 有 ATL_dgemv。那么，为什么链接器无法找到 HPCC 所需的所有内容呢？

谢谢。

Answer 1

您的日志表明 libhpl.a 需要 dgemv_ 符号，而 libcblas.a 和 libatlas 均未提供该符号。 a (我假设您的最后一个命令是 nm libatlas.a | grep dgemv)。

dgemv_ 中的尾部下划线强烈表明它需要 Fortran BLAS(而不是 C BLAS)库，因此您只需将 libcblas.a 替换为 libblas.a.

IIRC，另一个选项是调整 HPL 配置并指示其使用 cblas 而不是 (Fortran) BLAS。