java - 在 Protege 中导出推断的公理

Question

我正在学习本体论和 Protege 工具。我创建了 3 个类 A、B 和 C 的基本本体。

我使用 Equivalence 属性声明 A 类等同于 B 类。B 类等同于 C 类。然后我使用推理器 (Pellet) 确定 A 类等同于 C 类。

这种传递关系在 Protege 中非常有效。我可以看到黄色的 A 类等同于 C 类，反之亦然。

我想从 Protege 工具导出这个推断的公理。我转到“文件 -> 将推断的公理导出为本体”并在第一个屏幕上选择所有选项并且在第二个屏幕上不选择任何选项。最后，我将文件保存为 RDF/XML 语法中的 OWL。

现在当我打开这个新文件时，我没有看到任何关于推断公理的三元组，即类 A 等价于类 C。事实上，它与我的原始本体完全相同。

我不知道我错过了什么。我还尝试通过 Protege 的“Activity 本体选项卡”将导出的文件导入我的原始本体，然后执行“文件 -> 将推断的公理导出为本体”，但输出文件仍然不包含推断的三元组。当加载到 Protege 中并使用 reasoner 时，推理有效，但我希望 Protege 将此推理导出到 OWL 文件中。

这可能吗？我为此花了很多时间，并在 Internet 上四处寻找，但没有找到任何解决方案。我错过了一步吗？

顺便说一句，我使用了最新的 Protege 5.2 版，也尝试了 4.3 版以查看是否存在错误，但结果是一样的。

谢谢

我用的本体是这个

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// Classes
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<!-- http://www.semanticweb.org/sesa388470/ontologies/2017/9/23/untitled-ontology-110#A -->

<owl:Class rdf:about="http://www.semanticweb.org/sesa388470/ontologies/2017/9/23/untitled-ontology-110#A">
    <owl:equivalentClass rdf:resource="http://www.semanticweb.org/sesa388470/ontologies/2017/9/23/untitled-ontology-110#B"/>
</owl:Class>

<!-- http://www.semanticweb.org/sesa388470/ontologies/2017/9/23/untitled-ontology-110#B -->

<owl:Class rdf:about="http://www.semanticweb.org/sesa388470/ontologies/2017/9/23/untitled-ontology-110#B">
    <owl:equivalentClass rdf:resource="http://www.semanticweb.org/sesa388470/ontologies/2017/9/23/untitled-ontology-110#C"/>
</owl:Class>

<!-- http://www.semanticweb.org/sesa388470/ontologies/2017/9/23/untitled-ontology-110#C -->

<owl:Class rdf:about="http://www.semanticweb.org/sesa388470/ontologies/2017/9/23/untitled-ontology-110#C"/>

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更新 1:如果我在“文件 -> 将推断的公理导出为本体”的最后一步中选择 OWL/XML 作为本体格式，我可以在生成的本体文件中看到以下内容。

<Declaration>
    <Class IRI="#A"/>
</Declaration>
<Declaration>
    <Class IRI="#C"/>
</Declaration>
<Declaration>
    <Class IRI="#B"/>
</Declaration>
<EquivalentClasses>
    <Class IRI="#A"/>
    <Class IRI="#B"/>
    <Class IRI="#C"/>
</EquivalentClasses>

之前我以 RDF/XML 格式导出本体。至少我可以看出 A、B 和 C 是等价类。也许是 RDF vs OWL 问题？

更新 2:我在 Protege Dev 列表中收到了以下回复。似乎推断出的公理并没有被设计为以 RDF/XML 格式保存。

“OWL RDF/XML 语法不支持像等价类这样的 n 元构造函数，因为一切都应该使用三元组表示(因为 RDF)。在您的示例中，推断的公理 EquivalentClasses(A B C) 在 RDF 中被序列化[1](见表 1)到

A owl:equivalentClass B 。

B owl:equivalentClass C 。

OWL/XML 或 OWL 函数式语法等其他格式支持 n 元公理。这与您观察到的一致。

此外，在相关说明中，请注意推断公理生成器不会保存推理器生成的所有推断公理。例如，如果你的本体有公理 A subClassOf B 和 B subClassOf C，那么推断的公理 A subClassOf C 将不会被保存，因为它遵循其他(推断的)公理 A subClassOf B 和 B subClassOf C。只有非冗余的推断公理(不遵循其他推断公理的)被保存。这是因为可能有太多的推断公理。”

[1] https://www.w3.org/TR/owl2-mapping-to-rdf/#Translation_of_Axioms_without_Annotations

Answer 1

我明白你的意思。您希望在导出的本体中看到 A 和 C 之间的等价类公理，对吗？

我可以复制它。看起来 Protege 编辑器假设它已经是一个断言的公理。至少，当我再次打开本体时，编辑器在类层次结构树中将其呈现为:

输入本体:

@prefix : <http://www.semanticweb.org/user/ontologies/2017/9/untitled-ontology-3#> .
@prefix owl: <http://www.w3.org/2002/07/owl#> .
@prefix rdf: <http://www.w3.org/1999/02/22-rdf-syntax-ns#> .
@prefix xml: <http://www.w3.org/XML/1998/namespace> .
@prefix xsd: <http://www.w3.org/2001/XMLSchema#> .
@prefix rdfs: <http://www.w3.org/2000/01/rdf-schema#> .
@base <http://www.semanticweb.org/user/ontologies/2017/9/untitled-ontology-3> .

<http://www.semanticweb.org/user/ontologies/2017/9/untitled-ontology-3> rdf:type owl:Ontology .

#################################################################
#    Classes
#################################################################

###  http://www.semanticweb.org/user/ontologies/2017/9/untitled-ontology-3#A
:A rdf:type owl:Class ;
   owl:equivalentClass :B .


###  http://www.semanticweb.org/user/ontologies/2017/9/untitled-ontology-3#B
:B rdf:type owl:Class ;
   owl:equivalentClass :C .


###  http://www.semanticweb.org/user/ontologies/2017/9/untitled-ontology-3#C
:C rdf:type owl:Class .


###  Generated by the OWL API (version 4.2.8.20170104-2310) https://github.com/owlcs/owlapi

导出推断的公理并在 Protege 中重新打开后:

这可能是错误，也可能是预期的行为。您应该先在 Protege 邮件列表上询问。