java - java中的广义线性混合效应模型

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我有一个 R 代码，它使用 glmer 方法创建广义线性混合效应模型，我需要将此代码移植到 java。

是否有一个库可以提供开箱即用的此功能？

我尝试过谷歌等，但可以找到任何直接有用的东西。

有没有办法使用 Apache Math 库实现混合效应回归？

我仍在学习混合效应模型的概念，尚未完全理解这些概念。我在这里找到了一个提供多元回归的类，http://commons.apache.org/proper/commons-math/apidocs/org/apache/commons/math3/stat/regression/MultipleLinearRegression.html我想我也许可以用它来实现我需要的东西。

以前有人尝试过做类似的事情吗？

Answer 1

您可以使用 rJava 包。它要求机器上安装 R，但是，它允许从 java 调用 R 代码。

要使用它，您需要先安装它install.packages('rJava')。之后，您需要将以下内容添加到 R 的目录中

<R_HOME>\bin\i386;
<R_HOME>\library\rJava\jri\i386;

在 java 中，您需要添加来自的所有 jar

<R_HOME>\library\rJava\jri 

到你的类路径。

之后就可以调用rJava了

Rengine eng = new Rengine(new String[] { "--no-save" }, false, null);

String[] colNames = {"col1", "col2", "col3"};
String[] col1 = {"a1", "a2", "a3", "a4"};
String[] col2 = {"b1", "b2", "b3", "b4"};
int[] col3 = {1, 2, 3, 4};

REXP mydf = REXP
            .createDataFrame(new RList(
                    new REXP[] {
                            new REXPString(col1),
                            new REXPString(col2),
                            new REXPInteger(col3)},
                    colNames));
//generate a dataframe inr engine
eng.assign("myDataFrame", mydf);

 //Calculate MEAN of vector using R syntax.
 eng.eval("meanVal=mean(myDataFrame$col3)");

 //Retrieve MEAN value
 double mean = eng.eval("meanVal").asDouble();