java - rJava:如何获取堆栈跟踪/更详细的错误？

Question

有没有办法让 rJava 打印出错误的完整堆栈跟踪，而不仅仅是异常？例如，此代码(尝试从 R 调用 Ambit2 化学信息学库)

smrkMan <- .jnew("ambit2.smarts.SMIRKSManager", dcob)
reaction <- .jcall(smrkMan, "Lambit2/smarts/SMIRKSReaction;", "parse", ">>C" )
res <-  .jcall(smrkMan, "Z", "applyTransformation", AC, 
             .jnull("ambit2/smarts/IAcceptable"),
             reaction)

只给我

Fehler in .jcall(smrkMan, "Z", "applyTransformation", AC,
.jnull("ambit2/smarts/IAcceptable"),  : 
java.lang.NullPointerException

这不是很有用，我想看看它在哪一行失败，这样我就可以返回并在源代码中跟踪它...

有可能吗？

Answer 1

您可以使用 .jgetEx() 获取异常对象并打印堆栈跟踪:

> .jcall("C",,"main",check=FALSE)
> ex=.jgetEx()
> .jcheck()
Error: java.lang.Exception: foo
> ex$printStackTrace()
java.lang.Exception: foo
    at C.main(C.java:3)

与

public class C {
  static void main() throws Exception {
  throw new Exception("foo"); } }

只需确保在调用 printStackTrace() 之前调用 .jclear() 或 .jcheck()，因为 Java 不会这样做清除异常之前的任何操作。