java - 使用 rJava 加载数据

Question

我使用 rJava 将 Java 和 R 集成到我的项目中。

我需要在我的应用程序中加载 GWmodel R 包并通过 Java 计算距离矩阵。

这是我加载 GWmodel 并计算距离矩阵的函数:

Rengine engine = new Rengine(new String[] { "--no-save" }, false, null);
engine.eval("library(GWmodel)");
engine.eval("data(LondonHP)");
engine.eval("DM <- gw.dist(dp.locat=coordinates(londonhp))");
double[][] matrix = engine.eval("DM").asMatrix();

但是代码结果出现错误:

Exception in thread "main" java.lang.NullPointerException
    at rjavaexm.RJavaExm.main(RJavaExm.java:30)

所以，我想知道，是否可以像上面的代码一样使用 rJava 从 Java 加载 R 包和数据？

或者有什么合适的方法可以做到这一点吗？

Answer 1

我正在使用 Maven，所以我有以下内容(从一个简单的 Maven 项目生成)

mvn archetype:generate   -DgroupId=com.test.rserve  -DartifactId=com.test.rserve

选择默认选项。

pom.xml

<project xmlns="http://maven.apache.org/POM/4.0.0" xmlns:xsi="http://www.w3.org/2001/XMLSchema-instance"
  xsi:schemaLocation="http://maven.apache.org/POM/4.0.0 http://maven.apache.org/maven-v4_0_0.xsd">
  <modelVersion>4.0.0</modelVersion>
  <groupId>com.test.rserve</groupId>
  <artifactId>com.test.rserve</artifactId>
  <packaging>jar</packaging>
  <version>1.0-SNAPSHOT</version>
  <name>com.test.rserve</name>
  <url>http://maven.apache.org</url>
  <dependencies>
  <dependency>  
    <groupId>org.rosuda.REngine</groupId>
    <artifactId>Rserve</artifactId>
    <version>1.8.1</version>
    </dependency>    
  </dependencies>
</project>

App.java

package com.test.rserve;

import org.rosuda.REngine.REXP;
import org.rosuda.REngine.REXPMismatchException;
import org.rosuda.REngine.Rserve.RConnection;
import org.rosuda.REngine.Rserve.RserveException;


public class App {

    public static void main(String[] args) throws RserveException,
            REXPMismatchException {
        RConnection c = new RConnection();
        REXP x = c.eval("R.version.string");
        System.out.println(x.asString());   
    c.eval("library(GWmodel)");
    c.eval("data(LondonHP)");
    c.eval("DM <- gw.dist(dp.locat=coordinates(londonhp))");
    REXP y = c.eval("dim(DM)[1]");
    System.out.println(y.asString());
    c.close();
    }
}

确保 Rserve 包已安装在您的 R 环境中。

来自 R

library(Rserve)
Rserve()

使用 maven(命令行，另一个 shell)

mvn exec:java -Dexec.mainClass="com.test.rserve.App"

我们得到了我的设置:

R version 3.2.4 (2016-03-16)
316

之后不要忘记关闭 Rserve 服务器/进程...