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我正在尝试传输一个未知子类但已知基类的类。
我相信这应该可以使用 boost::serialization
、BOOST_CLASS_EXPORT_GUID
和 boost::mpi
,但我对一般的 C++
这是我的代码:
#include <boost/mpi.hpp>
#include <boost/mpi/environment.hpp>
#include <boost/mpi/communicator.hpp>
#include <boost/serialization/string.hpp>
#include <boost/serialization/serialization.hpp>
#include <boost/serialization/export.hpp>
#include <boost/serialization/vector.hpp>
#include <iostream>
namespace mpi = boost::mpi;
class Action {
protected:
int start_rank;
std::string greeting;
Action(std::string greeting) {
mpi::communicator world;
this->start_rank = world.rank();
this->greeting = greeting;
};
private:
friend class boost::serialization::access;
template<class Archive> void serialize(Archive &ar, const unsigned int version) {
ar & this->start_rank;
ar & this->greeting;
};
public:
Action() = default;
void invoke() {
mpi::communicator world;
std::cout << this->greeting << "! I am process " << world.rank() << " of " << world.size()
<< ". I was created on " << this->start_rank << "." << std::endl;
};
};
class HelloAction : public Action {
public:
HelloAction() : Action("Hello") {};
};
class GoodByeAction : public Action {
public:
GoodByeAction() : Action("Good bye") {};
};
BOOST_CLASS_EXPORT_GUID(Action, "Action");
BOOST_CLASS_EXPORT_GUID(HelloAction, "HelloAction");
BOOST_CLASS_EXPORT_GUID(GoodByeAction, "GoodByeAction");
int main() {
mpi::environment env;
mpi::communicator world;
HelloAction *hello = new HelloAction();
mpi::broadcast(world, hello, 0);
hello->invoke();
GoodByeAction *bye = new GoodByeAction();
mpi::broadcast(world, bye, 1);
bye->invoke();
world.barrier();
if (world.rank() == 0) {
std::cout << "sending unknown action classes!" << std::endl;
HelloAction *yup = new HelloAction();
boost::mpi::packed_oarchive oar(world);
oar << yup;
}
else {
std::cout << "receiving unknown action classes!" << std::endl;
Action *action = NULL;
boost::mpi::packed_iarchive iar(world);
iar >> action;
action->invoke();
}
return 0;
}
编译/运行:
mpic++ -g -std=c++1y hello.cpp -lboost_serialization -lmpi -lboost_mpi
mpiexec -np 2 ./a.out
这似乎运行得很好:
Hello! I am process 0 of 2. I was created on 0.
Hello! I am process 1 of 2. I was created on 0.
Good bye! I am process 1 of 2. I was created on 1.
Good bye! I am process 0 of 2. I was created on 1.
...直到到达“发送/接收未知操作类”,在那里我遇到运行时错误:
receiving unknown action classes!
sending unknown action classes!
terminate called after throwing an instance of 'boost::exception_detail::clone_impl<boost::exception_detail::error_info_injector<boost::mpi::exception> >'
what(): MPI_Unpack: MPI_ERR_ARG: invalid argument of some other kind
[machine-name:20194] *** Process received signal ***
[machine-name:20194] Signal: Aborted (6)
[machine-name:20194] Signal code: (-6)
[machine-name:20194] [ 0] /lib/x86_64-linux-gnu/libc.so.6(+0x352f0) [0x7fa685cc22f0]
[machine-name:20194] [ 1] /lib/x86_64-linux-gnu/libc.so.6(gsignal+0x37) [0x7fa685cc2267]
[machine-name:20194] [ 2] /lib/x86_64-linux-gnu/libc.so.6(abort+0x16a) [0x7fa685cc3eca]
[machine-name:20194] [ 3] /usr/lib/x86_64-linux-gnu/libstdc++.so.6(_ZN9__gnu_cxx27__verbose_terminate_handlerEv+0x16d) [0x7fa6862fdb7d]
[machine-name:20194] [ 4] /usr/lib/x86_64-linux-gnu/libstdc++.so.6(+0x8d9c6) [0x7fa6862fb9c6]
[machine-name:20194] [ 5] /usr/lib/x86_64-linux-gnu/libstdc++.so.6(+0x8da11) [0x7fa6862fba11]
[machine-name:20194] [ 6] /usr/lib/x86_64-linux-gnu/libstdc++.so.6(+0x8dc29) [0x7fa6862fbc29]
[machine-name:20194] [ 7] ./a.out(_ZN5boost15throw_exceptionINS_3mpi9exceptionEEEvRKT_+0x80) [0x41426d]
[machine-name:20194] [ 8] ./a.out() [0x413802]
[machine-name:20194] [15] ./a.out() [0x4306e6]
[machine-name:20194] [16] /usr/lib/x86_64-linux-gnu/libboost_serialization.so.1.58.0(_ZN5boost7archive6detail19basic_iarchive_impl12load_pointerERNS1_14basic_iarchiveERPvPKNS1_25basic_pointer_iserializerEPFS9_RKNS_13serialization18extended_type_infoEE+0x4d) [0x7fa686df5b8d]
[machine-name:20194] [17] ./a.out() [0x41d08d]
[machine-name:20194] [23] ./a.out() [0x40d293]
[machine-name:20194] [24] /lib/x86_64-linux-gnu/libc.so.6(__libc_start_main+0xf0) [0x7fa685cada40]
[machine-name:20194] [25] ./a.out() [0x40cfc9]
[machine-name:20194] *** End of error message ***
--------------------------------------------------------------------------
mpiexec noticed that process rank 1 with PID 20194 on node machine-name exited on signal 6 (Aborted).
--------------------------------------------------------------------------
问题:
boost
,但是是否有可能在有或没有boost的情况下传输一个未知的子类?我知道我可以通过字符串名称进行各种注册,以及一个控制反转的人来处理创建,但我认为这是 BOOST_CLASS_EXPORT_GUID
的意图。boost
)来使这项工作与常规的 ol' MPI 一起工作?最佳答案
您非常接近:首先,您缺少打包存档的实际通信功能。您正在尝试从 packed_iarchive
中提取内容,但尚未收到该存档中的任何内容。例如,您可以使用 broadcast
作为 described :
with packed archives, the root sends a packed_oarchive [...] whereas the other processes receive a acked_iarchive [...].
但是,只需将调用添加到您的示例中,就会实例化一个 Action
而不是 HelloAction
。这需要更多的努力:
HelloAction*
,然后反序列化 Action*
,无论它是否是虚拟类1。如果你在这两种情况下都必须使用 Action*
,你当然也必须使用虚拟类,这样 boost 实际上就知道运行时类型。从技术上讲,您可以将 Action*
序列化为 HelloAction
对象,然后反序列化产生 sliced 的 Action*
。 Action
- 原件的一部分。同样,这适用于您的示例,但它不适用于更复杂的示例,因此不是一个好主意。序列化
1。将所有这些放在一起,一个工作示例如下所示:注意:我添加了更多输出以验证是否使用正确的类型创建了对象。
#include <boost/mpi.hpp>
#include <boost/mpi/environment.hpp>
#include <boost/mpi/communicator.hpp>
#include <boost/serialization/string.hpp>
#include <boost/serialization/serialization.hpp>
#include <boost/serialization/export.hpp>
#include <boost/serialization/vector.hpp>
#include <iostream>
namespace mpi = boost::mpi;
class Action {
protected:
int start_rank;
std::string greeting;
Action(std::string greeting) {
mpi::communicator world;
std::cout << world.rank() << ": Creating a Action: " << greeting << std::endl;
this->start_rank = world.rank();
this->greeting = greeting;
};
private:
friend class boost::serialization::access;
template<class Archive> void serialize(Archive &ar, const unsigned int version) {
ar & this->start_rank;
ar & this->greeting;
};
public:
virtual ~Action() = default;
Action() {
mpi::communicator world;
std::cout << world.rank() << ": Creating a naked Action" << std::endl;
}
void invoke() {
mpi::communicator world;
std::cout << this->greeting << "! I am process " << world.rank() << " of " << world.size()
<< ". I was created on " << this->start_rank << "." << std::endl;
};
};
class HelloAction : public Action {
public:
HelloAction() : Action("Hello") {
mpi::communicator world;
std::cout << world.rank() << ": Creating an HelloAction" << std::endl;
}
template<typename Archive>
void serialize(Archive & ar, const unsigned int file_version) {
ar & boost::serialization::base_object<Action>(*this);
}
};
class GoodByeAction : public Action {
public:
GoodByeAction() : Action("Good bye") {
mpi::communicator world;
std::cout << world.rank() << ": Creating an GoodByeAction" << std::endl;
}
template<typename Archive>
void serialize(Archive & ar, const unsigned int file_version) {
ar & boost::serialization::base_object<Action>(*this);
}
};
// It is totally fine to use the EXPORT (without GUID) for MPI
BOOST_CLASS_EXPORT(GoodByeAction)
BOOST_CLASS_EXPORT(HelloAction)
int main() {
mpi::environment env;
mpi::communicator world;
HelloAction *hello = new HelloAction();
mpi::broadcast(world, hello, 0);
hello->invoke();
GoodByeAction *bye = new GoodByeAction();
mpi::broadcast(world, bye, 1);
bye->invoke();
world.barrier();
if (world.rank() == 0) {
std::cout << "sending unknown action classes!" << std::endl;
Action *yup = new HelloAction();
boost::mpi::packed_oarchive oar(world);
oar << yup;
mpi::broadcast(world, oar, 0);
}
else {
std::cout << "receiving unknown action classes!" << std::endl;
boost::mpi::packed_iarchive iar(world);
mpi::broadcast(world, iar, 0);
Action *action = nullptr;
iar >> action;
std::cout << "RTTI: " << typeid(*action).name() << std::endl;
action->invoke();
}
return 0;
}
关于普通的旧 MPI:对我来说听起来像是重新发明轮子 - 当然可能,但不一定可取。
1 我在文档中找不到关于此的明确声明。这是基于如果您尝试其他方式,事情就会变得非常糟糕。我将不胜感激对此发表评论/更好的回答。
关于c++ - 使用 boost::mpi::packed_oarchive 和 packed_iarchive 进行未知子类的 MPI 传输,我们在Stack Overflow上找到一个类似的问题: https://stackoverflow.com/questions/36308038/
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我正在开发一些程序,而不是在每个节点上有 4 个内核的 4 节点集群上运行。我有一个非常快的 OpenMP 版本的程序,它只在一个集群上运行,我正在尝试使用 MPI 扩展它。由于我的经验有限,我想知道
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冗长的背景 我正在为心脏电生理学模拟并行处理一些代码。由于用户可以使用内置脚本语言指定他们自己的模拟,我无法知道如何在通信与计算之间进行权衡。为了解决这个问题,我正在制作一种运行时分析器,一旦看到要运
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我可以在我的大学使用 PelicanHPC 访问集群网络,其中运行各种 MPI 程序,但在家里我想练习编写/使用其他 MPI 程序。有没有办法在我自己的系统上运行 MPI 程序? (我在 Ubuntu
我是一名优秀的程序员,十分优秀!