c++ - boost 测试单元无法调用 mpi 函数

Question

我仔细查看了一圈，但找不到任何关于这个问题的引用资料。

我编写了一个 C++ 程序，我正在使用 boost/unit 进行测试。串行版本工作正常，单元测试正常。
现在，我已经通过一个与 MPI 进行令人尴尬的并行工作的函数使程序并行化。如果写下我自己的调用并行函数的测试——我们称之为辅助函数——它运行良好，MPI 运行正常。
编译是用 mpic++ 完成的，我用 mpixec 来运行程序。

但是，如果我在 boost 测试用例中调用 parafunction，MPI 就会出错，多次启动测试，并且在调用多个 MPI::Init 时进程崩溃。这是我得到的错误示例:

The MPI_comm_size() function was called after MPI_FINALIZE was invoked.

This is disallowed by the MPI standard.

Your MPI job will now abort.

我的测试用例在 test_unit 上，由 master_test_suite 自动处理。正如我所说，没有并行化它工作得很好。

Parafunction 调用 MPI::Init 和 MPI::Finalize，文件的其他函数不应该做任何 MPI 相关的事情。

有没有人遇到过类似的问题？

我的测试运行时间很长，因此我真的可以使用我的程序的并行版本!

谢谢你的帮助

Answer 1

一个既初始化又完成的函数只能调用一次，因为MPI在程序的生命周期内只能初始化一次，也只能完成一次。为防止多次初始化调用，请将对 MPI_Init() 或 MPI_Init_thread() 的调用放在条件中:

int already_initialised;

MPI_Initialized(&already_initialised);
if (!already_initialised)
   MPI_Init(NULL, NULL);

至于最终确定，如果您不想用 MPI 调用污染外部作用域，则应将其移出您的函数，可能在 atexit(3) 处理程序中。例如:

void finalise_mpi(void)
{
   int already_finalised;

   MPI_Finalized(&already_finalised);
   if (!already_finalised)
      MPI_Finalize();
}

...
atexit(finalise_mpi);
...

atexit() 调用可以是初始化代码的一部分，例如:

int already_initialised;

MPI_Initialized(&already_initialised);
if (!already_initialised)
{
   MPI_Init(NULL, NULL);
   atexit(finalise_mpi);
}

如果 MPI 已经初始化，这将不会安装 atexit(3) 处理程序。基本思想是，如果 MPI 在函数入口处被初始化，则意味着 MPI_Init() 在外部作用域中被调用，并且通常期望 MPI_Finalize() 也在那里被调用。

如果我是你，我会将 MPI 初始化和终结移出并行处理函数。正确的调用顺序是初始化 MPI，运行测试，然后完成 MPI。

我在上面的文本中使用了 C 绑定(bind)，因为 C++ 绑定(bind)在 MPI-2.2 中被弃用，然后在 MPI-3.0 中被删除。