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c++ - 用户定义的 Eigen 函数使用的内存是预期的两倍

转载 作者:行者123 更新时间:2023-11-30 03:15:44 25 4
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我定义了以下函数(MWE)

(请注意,公式是对以下公式的改编:How to Build a Distance Matrix without a Loop (Vectorization)? 以及 http://nonconditional.com/2014/04/on-the-trick-for-computing-the-squared-euclidian-distances-between-two-sets-of-vectors/)

#include <stdlib.h>
#include <chrono>
#include <Eigen/Dense>
#include <iostream>

using MyMatrix = Eigen::MatrixXd;
using MyMatrix1D = Eigen::VectorXd;

//Calculates e^(scale * ||x-y||_2^2), where ||x-y|| is euclidean distatnce
MyMatrix get_kernel_matrix(const Eigen::Ref<const MyMatrix> x, const Eigen::Ref<const MyMatrix> y)
{
const double scale = 0.017;
const MyMatrix1D XX = x.array().square().rowwise().sum().matrix();
const MyMatrix1D YY = y.array().square().rowwise().sum().matrix();
return (((((-2*x)*y.transpose()).colwise() + XX).rowwise() + YY.transpose()).array() * scale).exp().matrix();
}

int main(int argc, char** argv) {
const int num_x = 2500;
const int num_y = 2500;

const MyMatrix X = MyMatrix::Random(num_x, 2);
const MyMatrix Y = MyMatrix::Random(num_y, 2);

const auto t_b_gen = std::chrono::high_resolution_clock::now();
const MyMatrix k_xp_x(std::move(get_kernel_matrix(X, Y)));
const auto t_a_gen = std::chrono::high_resolution_clock::now();
long t_gen = std::chrono::duration_cast<std::chrono::nanoseconds>(t_a_gen - t_b_gen).count();
std::cout << "Time: " << t_gen << std::endl;
}

哪个会占用 2500*2500*8bytes = 50MB 内存。但是,运行 /usr/bin/time -v kern_double 报告:Maximum resident set size (kbytes): 103288

通过 Massif 运行程序表明 50MB block 被分配了两次,一次是在 functin 调用中,一次是 Eigen::internal::cal_dense_assignment。我尝试使用和不使用 std::move 来强制复制省略,但是我无法减少内存占用。

我哪里做错了,我该如何解决这个问题以仅使用所需的内存而不是双倍的内存?

最佳答案

这是因为矩阵乘积 x*y.transpose() 默认情况下在临时值内求值以提高效率。您仍然可以通过如下方式拆分最后一个表达式来重用这个临时变量:

MyMatrix tmp = -2*x*y.transpose();
tmp = ((((tmp).colwise() + XX).rowwise() + YY.transpose()).array() * scale).exp();
return tmp;

请注意,这里既不需要.matrix(),也不需要std::move

关于c++ - 用户定义的 Eigen 函数使用的内存是预期的两倍,我们在Stack Overflow上找到一个类似的问题: https://stackoverflow.com/questions/56799088/

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