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我在我的网站代码的基础上学习了 javascript。然后,我尝试开发一个新的网络但失败了。谷歌之后,我仍然没有线索。所以我在这里寻求帮助。感谢您的提前。
我的想法是12.1.4。安装过程为:
1) 我通过选择“JavaEE Web Module”来创建新项目;
2)然后我复制之前的java脚本来处理mysql,下面列出了部分代码;
package inhouse;
import javax.naming.Context;
import javax.naming.InitialContext;
import javax.naming.NamingException;
import javax.sql.DataSource;
import java.sql.*;
public class DBTool {
private DataSource ds = null;
private Connection conn = null;
private Statement stm = null;
private ResultSet rs = null;
private Context ctx = null;
public DBTool() throws NamingException{
this("editingphosphorylation");
}
public DBTool(String dbName) throws NamingException{
try{
ctx = new InitialContext();
ds = (DataSource) ctx.lookup("java:comp/env/jdbc/" + dbName);
}
catch (NamingException e) {
throw new NamingException("Can't get DataSource from pool: " + e.getMessage());
}
}
public Connection getConnection() throws SQLException{
conn = ds.getConnection();
return conn;
}
......
}
3) 将“resource-ref”添加到 WEB-INF/web.xml;
<?xml version="1.0" encoding="UTF-8"?>
<web-app xmlns="http://java.sun.com/xml/ns/javaee"
xmlns:xsi="http://www.w3.org/2001/XMLSchema-instance"
xsi:schemaLocation="http://java.sun.com/xml/ns/javaee
http://java.sun.com/xml/ns/javaee/web-app_2_5.xsd"
version="2.5">
<resource-ref>
<description>DB Connection</description>
<res-ref-name>jdbc/editingphosphorylation</res-ref-name>
<res-type>javax.sql.DataSource</res-type>
<res-auth>Container</res-auth>
</resource-ref>
</web-app>
4) 下载“mysql-connector-java-5.1.40-bin.jar”,并将其放入WEB-INF/lib;
5)通过“查看工具Windows-数据库”,确认可以访问mysql数据库;
6)但是启动tomcat时,输出如下错误:
HTTP Status 500 - An exception occurred processing JSP page /geneList.jsp at line 26
type Exception report
message An exception occurred processing JSP page /geneList.jsp at line 26
description The server encountered an internal error that prevented it from fulfilling this request.
exception
org.apache.jasper.JasperException: An exception occurred processing JSP page /geneList.jsp at line 26
23:
24: try{
25: db = new DBTool();
26: conn = db.getConnection();
27: //Class.forName("com.mysql.jdbc.Driver").newInstance();
28: //Connection conn = java.sql.DriverManager.getConnection("jdbc:mysql://localhost:3306/editingphosphorylation","2pm","editingphosphorylation");
29: pst = conn.prepareStatement("select * from gene_sequence where geneName = ?");
Stacktrace:
org.apache.jasper.servlet.JspServletWrapper.handleJspException(JspServletWrapper.java:568)
org.apache.jasper.servlet.JspServletWrapper.service(JspServletWrapper.java:455)
org.apache.jasper.servlet.JspServlet.serviceJspFile(JspServlet.java:390)
org.apache.jasper.servlet.JspServlet.service(JspServlet.java:334)
javax.servlet.http.HttpServlet.service(HttpServlet.java:727)
org.apache.tomcat.websocket.server.WsFilter.doFilter(WsFilter.java:52)
root cause
javax.servlet.ServletException: org.apache.tomcat.dbcp.dbcp.SQLNestedException: Cannot create JDBC driver of class '' for connect URL 'null'
org.apache.jasper.runtime.PageContextImpl.doHandlePageException(PageContextImpl.java:916)
org.apache.jasper.runtime.PageContextImpl.handlePageException(PageContextImpl.java:845)
org.apache.jsp.geneList_jsp._jspService(geneList_jsp.java:147)
org.apache.jasper.runtime.HttpJspBase.service(HttpJspBase.java:70)
javax.servlet.http.HttpServlet.service(HttpServlet.java:727)
org.apache.jasper.servlet.JspServletWrapper.service(JspServletWrapper.java:432)
org.apache.jasper.servlet.JspServlet.serviceJspFile(JspServlet.java:390)
org.apache.jasper.servlet.JspServlet.service(JspServlet.java:334)
javax.servlet.http.HttpServlet.service(HttpServlet.java:727)
org.apache.tomcat.websocket.server.WsFilter.doFilter(WsFilter.java:52)
root cause
org.apache.tomcat.dbcp.dbcp.SQLNestedException: Cannot create JDBC driver of class '' for connect URL 'null'
org.apache.tomcat.dbcp.dbcp.BasicDataSource.createConnectionFactory(BasicDataSource.java:1452)
org.apache.tomcat.dbcp.dbcp.BasicDataSource.createDataSource(BasicDataSource.java:1371)
org.apache.tomcat.dbcp.dbcp.BasicDataSource.getConnection(BasicDataSource.java:1044)
inhouse.DBTool.getConnection(DBTool.java:39)
org.apache.jsp.geneList_jsp._jspService(geneList_jsp.java:85)
org.apache.jasper.runtime.HttpJspBase.service(HttpJspBase.java:70)
javax.servlet.http.HttpServlet.service(HttpServlet.java:727)
org.apache.jasper.servlet.JspServletWrapper.service(JspServletWrapper.java:432)
org.apache.jasper.servlet.JspServlet.serviceJspFile(JspServlet.java:390)
org.apache.jasper.servlet.JspServlet.service(JspServlet.java:334)
javax.servlet.http.HttpServlet.service(HttpServlet.java:727)
org.apache.tomcat.websocket.server.WsFilter.doFilter(WsFilter.java:52)
root cause
java.lang.NullPointerException
sun.jdbc.odbc.JdbcOdbcDriver.getProtocol(JdbcOdbcDriver.java:524)
sun.jdbc.odbc.JdbcOdbcDriver.knownURL(JdbcOdbcDriver.java:493)
sun.jdbc.odbc.JdbcOdbcDriver.acceptsURL(JdbcOdbcDriver.java:307)
java.sql.DriverManager.getDriver(DriverManager.java:262)
org.apache.tomcat.dbcp.dbcp.BasicDataSource.createConnectionFactory(BasicDataSource.java:1437)
org.apache.tomcat.dbcp.dbcp.BasicDataSource.createDataSource(BasicDataSource.java:1371)
org.apache.tomcat.dbcp.dbcp.BasicDataSource.getConnection(BasicDataSource.java:1044)
inhouse.DBTool.getConnection(DBTool.java:39)
org.apache.jsp.geneList_jsp._jspService(geneList_jsp.java:85)
org.apache.jasper.runtime.HttpJspBase.service(HttpJspBase.java:70)
javax.servlet.http.HttpServlet.service(HttpServlet.java:727)
org.apache.jasper.servlet.JspServletWrapper.service(JspServletWrapper.java:432)
org.apache.jasper.servlet.JspServlet.serviceJspFile(JspServlet.java:390)
org.apache.jasper.servlet.JspServlet.service(JspServlet.java:334)
javax.servlet.http.HttpServlet.service(HttpServlet.java:727)
org.apache.tomcat.websocket.server.WsFilter.doFilter(WsFilter.java:52)
任何geneList.jsp都是这样的
<%@ page contentType="text/html;charset=UTF-8" language="java" %>
<%@ page import="inhouse.*, java.sql.*" %>
<%@ page import="java.io.*" %>
<html>
<head>
<title>get gene list</title>
</head>
<body>
<% String geneName = request.getParameter("geneName");
DBTool db;
Connection conn = null;
PreparedStatement pst = null;
ResultSet rs = null;
try{
db = new DBTool();
conn = db.getConnection();
//Class.forName("com.mysql.jdbc.Driver").newInstance();
//Connection conn = java.sql.DriverManager.getConnection("jdbc:mysql://localhost:3306/editingphosphorylation","2pm","editingphosphorylation");
pst = conn.prepareStatement("select * from gene_sequence where geneName = ?");
pst.setString(1, geneName);
rs = pst.executeQuery();
if(rs.next()){
rs.beforeFirst();%>
<table>
<th>
<td>Gene Name</td><td>Transcript Name</td><td>DNA Sequence</td><td>Protein Sequence</td>
</th>
<%while(rs.next()){
String geneNameRetrieve = rs.getString("geneName");
String transcriptNameRetrieve = rs.getString("transcriptName");
String dnaSequenceRetrieve = rs.getString("dnaSequence");
String proteinSequenceRetrieve = rs.getString("proteinSequence"); %>
<tr>
<td><%=geneNameRetrieve%></td><td><%=transcriptNameRetrieve%></td><td><%=dnaSequenceRetrieve%></td><td><%=proteinSequenceRetrieve%></td>
</tr><%
}%>
</table>
<%}else{%>
<div>No data.</div>
<%}
DBTool.close(rs, pst);
}finally {
DBTool.close(conn);
}%>
</body>
</html>
与之前的项目相比,根据google,我发现新项目缺少META-INF目录,所以我在web中创建一个新目录,并在其中放入一个新的context.xml。
<?xml version='1.0' encoding='utf-8'?>
<Context path="/">
<Loader delegate="true" />
<!-- Default set of monitored resources -->
<WatchedResource>WEB-INF/web.xml</WatchedResource>
<Resource name="jdbc/editingprosphorylation" auth="Container" type="javax.sql.DataSource"
maxActive="555" maxIdle="50" maxWait="10000"
timeBetweenEvictionRunsMillis="60000"
username="2pm" password="editingprosphorylation" driverClassName="com.mysql.jdbc.Driver"
url="jdbc:mysql://localhost:3306/editingprosphorylation"/>
</Context>
但是,它不起作用。谷歌后,我几乎不知道该怎么做,任何建议将不胜感激!
最佳答案
打字错误:
编辑磷酸化
(编辑pH磷酸化)
editingprosphorylation
(编辑pRosphorylation)
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