mysql - InnoDB - IBD 文件不断增长，占用了服务器上的所有空间

Question

环境

我们在运行 MariaDB(版本 10.3.8)的 CentOS 服务器上有一个临时/测试 WordPress 站点。我们一直在尝试一个名为 GeoDirectory (https://wpgeodirectory.com/) 的插件，该插件在数据库中创建各种表。数据库还使用设置为 ON 的 innodb_file_per_table，因此数据库为数据库中的每个表空间生成了 IBD 文件。

问题

临时服务器有 80 GB 存储空间。对插件的设置进行特定更改(更新位置设置)后，我们注意到大约十分钟后，当我们尝试通过浏览器访问临时站点时，它超时了。

通过 SSH 登录，我们注意到机器完全没有空间。在/var 中寻找最大的文件时，我注意到一个文件现在占用了 70 GB 的空间 (wp_g1a4rar7xx_geodir_gd_place_detail.ibd)。这是与更新设置的表相对应的 IBD 文件。

登录 SQL 并对该表中的记录数运行 count(*)，结果只有 6,000 条记录。

因为表已经炸毁并占据了整个磁盘，因此即使尝试OPTIMIZE TABLE也无法工作，因为空间不足。

问题

到底发生了什么事情，使得该文件如此之快地膨胀得如此之大？今后我们如何避免这种情况发生？

鲁莽的猜测

根据搜索，我们认为这可能与 InnoDB 执行的回滚/日志记录有关，并且我们可以通过在 my.cnf 中进行一些更改以限制来避免这种情况记录。同样，它可能是完全不同的东西。

这是来自 /etc/my.cnf 的当前 my.cnf:

[mysqld]
bind-address = 0.0.0.0
# bind-address = ::ffff:127.0.0.1
local-infile=0
datadir=/var/lib/mysql
socket=/var/lib/mysql/mysql.sock
# Disabling symbolic-links is recommended to prevent assorted security 
risks
symbolic-links=0
# Settings user and group are ignored when systemd is used.
# If you need to run mysqld under a different user or group,
# customize your systemd unit file for mariadb according to the
# instructions in http://fedoraproject.org/wiki/Systemd

[mysqld_safe]
log-error=/var/log/mariadb/mariadb.log
pid-file=/var/run/mariadb/mariadb.pid

#
# include all files from the config directory
#
!includedir /etc/my.cnf.d

预先感谢您的帮助!

Answer 1

根据插件的名称，我猜测该问题可能与索引几何列的更新有关。 MariaDB Server 10.2 从 MySQL 5.7 导入了对 SPATIAL INDEX 的 InnoDB 支持，并且看起来有时会跳过版本历史记录的清除，具体取决于并发 DML 事件。

我在 MDEV-15284 中提到过这种奇特的设计选择，它报告如果正在执行并发 ROLLBACK，则 SPATIAL INDEX 上的 SELECT 可能会返回不一致的结果。