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python - 导入 shp2pgsql 后无法设置 psycopg2 自动提交

转载 作者:行者123 更新时间:2023-11-29 13:52:12 29 4
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我正在使用 shp2pgsql 将 shapefile 加载到 postGIS 数据库中,通过 psql 进行管道传输,包裹在这样的 python 子进程中:

command = "shp2pgsql -s 4269 -a -D -W LATIN1 file.shp table | psql -h host -d db -U user"
p=subprocess.Popen(command, shell=True)
p.communicate()

这非常有效,输出如下:

Loading objects...
Shapefile type: Polygon
Postgis type: MULTIPOLYGON[2]
SET
SET
BEGIN
COMMIT

没有 END 语句,但据我所知,ENDCOMMIT 是等价的。

然后我想为到同一数据库的 psycopg2 连接设置 con.autocommit = True。我收到以下错误:

psycopg2.ProgrammingError: autocommit cannot be used inside a transaction

为什么 psycopg2 报告交易仍在进行中?我应该以其他方式关闭 psql 事务吗?

如果我不运行 shp2pgsql 子进程命令,con.autocommit 会成功执行。 shp2pgsql 默认情况下是否在某处打开事务? (http://www.bostongis.com/pgsql2shp_shp2pgsql_quickguide.bqg 不建议这样做)

pg_locks 中不存在相关条目来建议停滞/空闲事务。我没有在 shp2pgsql 函数中使用 psycopg2 连接对象。而且,如果我重新创建一个新的连接对象

con = psycopg2.connect(host=db_host, user=db_user, password=db_pass, database=db_name)

在 shp2pgsql 函数之后,con.autocommit=True 工作正常。

编辑:我当然可以在所有 shp2pgsql 导入完成后简单地创建 psycopg2 连接对象,但这在我的代码中并不理想,我宁愿了解发生了什么。

Edit2:在打开 psycopg2 连接后立即设置 con.autocommit=True,而不是稍后设置,绕过此错误。

Edit3:添加 MWE

import psycopg2
import os
import subprocess
from glob import glob

def vacuum(con, table=""):
autocommit_orig = con.autocommit
con.autocommit = True
with con.cursor() as cur:
cur.execute("VACUUM ANALYZE {};".format(table))
con.autocommit = autocommit_orig

def read_shapefile(path, tablename, srid="4269"):
command = "shp2pgsql -s {} -a -D -W LATIN1 {} {} | psql -h {} -d {} -U {}".format(srid, path, tablename, host, dbname, user)
p=subprocess.Popen(command, shell=True)
p.communicate()

def load_data(con, datapath):
dir = os.path.join(datapath,dataname)
shapefiles = glob(os.path.join(dir,"*.shp"))

for shapefile in shapefiles:
read_shapefile(shapefile, tablename)

if __name__ == "__main__":
con = psycopg2.connect(host=db_host, user=db_user, password=db_pass, database=db_name)
load_data(con, datapath)
vacuum(con, tablename)

最佳答案

我看不出这是在哪里发生的,但根据 this , this , 和 this , 事务在第一次向数据库发送命令时开始。

事务是按连接进行的,所以 psql 不应该让你失望。

正在关注 this advice ,我的建议是您在代码中的 con.autocommit=True 之前添加一个 con.rollback()。这将结束以某种方式开始的隐式事务。如果您仍然拥有您期望的所有数据,那么就会发出 SELECT 命令或类似的只读指令。

如果您将 con.rollback()con.autocommit=True 向后移动,它将允许您在不重构代码的情况下隔离事务开始的位置。

这是一个猜测,但也许当 psql 改变数据库状态时 psycopg2 开始一个事务?我还没有找到支持这个假设的文档。

关于python - 导入 shp2pgsql 后无法设置 psycopg2 自动提交,我们在Stack Overflow上找到一个类似的问题: https://stackoverflow.com/questions/39028663/

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