Mysql 查询在服务器端执行时有效，但在客户端执行时无效

Question

****解决方案***

我必须将查询用双引号而不是单引号括起来。

如果我登录到以下 mysql 服务器:

mysql --user=genome --host=genome-mysql.cse.ucsc.edu -A

然后运行以下查询:

select distinct 
    kgID, genesymbol, refseq 
from 
    kgXref 
where 
    genesymbol = 'GLRA1') a 
inner join 
    (select * from knownGene) b on a.kgID = b.name 
inner join 
    (select distinct 
         name, transcript, chromStart, chromEnd, 
         substr(peptides, 1, 1) as ref_pep,
         substr(peptides, 3, 1) as mut_pep 
     from 
         snp137CodingDbSnp) c on a.refseq = c.transcript

我得到了我想要的结果。

但是，如果我按以下方式运行它:

mysql --user=genome --host=genome-mysql.cse.ucsc.edu -A hg19 -D hg19 -e 'select distinct c.name,c.transcript from  (select distinct kgID,genesymbol,refseq from kgXref where genesymbol = 'GLRA1') a inner join (select * from knownGene) b on a.kgID = b.name inner join (SELECT distinct name, transcript,chromStart,chromEnd, substr(peptides,1,1) as ref_pep,substr(peptides,3,1) as mut_pep FROM snp137CodingDbSnp) c on a.refseq = c.transcript'

我收到以下错误

ERROR 1054 (42S22) at line 1: Unknown column 'GLRA1' in 'where clause'

其中 GLRA1 不是一列，而是列geneSymbol 中的一个id。

为什么当我登录到服务器时查询可以工作，但当我以第二种方式运行它时却不行？

Answer 1

简单 - 您过早结束“报价”:

-e 'select distinct c.name,c.transcript from  (select distinct kgID,genesymbol,refseq from kgXref where genesymbol = 'GLRA1')

GLRA1 之前的 ' 将关闭 select 关键字之前的开引号。