bash - 如何使用 sed 有选择地替换一组三个字符

Question

我需要替换文本中的三个特定字符(三元组)。我想匹配从位置 1、4、7、10、13 等开始但不在位置 2、3、5、6 等开始的模式。

例如，我想在文本 ctaagctaaggcgtaaga 中用 NNN 查找/替换 taa，我想得到 ctaagcNNNggcgtaaga.

'taa' 的第一次出现从位置 2 开始，不应被匹配/替换，第二次出现从位置 7 开始并被替换，第三次出现从位置 14 开始并且不匹配。

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到目前为止，我的解决方案是用“+”分隔三元组，进行替换并删除所有“+”。但是，我正在考虑使用单个 sed 命令的更优雅的解决方案。

echo $dna | sed 's/.../&+/g;s/+$//' | sed 's/taa/NNN/g' | sed 's/+//g'

Answer 1

据我所知，您将需要多个 sed 命令来完成此操作。但是，您可以在 sed 的一次调用中执行所有命令，例如:

<<<ctaagctaaggcgtaaga bsdsed 's/.../&+/g; s/taa/NNN/g; s/+//g'

输出:

ctaagcNNNggcgtaaga