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我有一个文件,我想在其中找到第三列和第四列不同的所有行。我的文件看起来像:
chr1:109506687 [T/G] BOT TOP
chr1:109506690 [T/G] BOT TOP
...
我用来查找这些行的代码是
awk '$3 != $4 {print $0}' Cardio-Metabo_Chip_11395247_A.txt | shuf -n 10
问题是使用这个命令我得到的结果是
rs3218791 [A/C] TOP TOP
第三列和第四列相同。
当我使用条件相等时,即 ==
我没有得到任何输出,这告诉我 awk 从不认为两列 $3 和 $4 相等,尽管它们经常如此。
附言。在 vim 中使用 :set list
,我的文件如下所示:
chr1:109506687^I[T/G]^IBOT^ITOP$
chr1:109506690^I[T/G]^IBOT^ITOP$
....
我的 awk 版本是 GNU Awk 3.1.8,但我无法想象它需要做很多事情。这在 1.0 中应该是正确的
可能出了什么问题?
最佳答案
虽然我无法重现您的问题(见下文),但我认为您正在以数字方式而不是字符串方式评估这些值(所有非空字符串 — 甚至 "0"
— 以数字方式评估为 1
)。试试这个:
awk '$3 != $4 "" {print $0}' test
这会将 $4
与一个空字符串连接起来,因此应该强制执行您想要的字符串比较。
我未能用 mawk 1.2 和 gawk 4.0.1 重现您的问题:
$ cat test
chr1:109506687 [T/G] BOT TOP
chr1:109506690 [T/G] BOT TOP
rs3218791 [A/C] TOP TOP
$ mawk '$3 != $4 {print $0}' test
chr1:109506687 [T/G] BOT TOP
chr1:109506690 [T/G] BOT TOP
$ gawk '$3 != $4 {print $0}' test
chr1:109506687 [T/G] BOT TOP
chr1:109506690 [T/G] BOT TOP
shuf
管道不应该与它有任何关系,制表符与空格也不应该。 (虽然为了安全起见,我在测试中尝试了所有组合。)
有趣的提示:{print $0}
是隐含的,如果只有一个子句没有任何 Action 。因此,awk '$3 != $4'
与 awk '$3 != $4 {print $0}'
相同......但请确保您没有编写代码让你的同龄人更难阅读。
关于bash - awk 字符串不等式似乎不起作用,我们在Stack Overflow上找到一个类似的问题: https://stackoverflow.com/questions/21597342/
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