python - 如何在 PyPy 上使用 Biopython？

Question

我知道 PyPy 在 Numpy 和 Biopython 中的其他东西上有问题，但并不是所有的 BioPython 模块都使用这些东西......有人知道如何将模块 Bio 导入 PyPy 并使用它吗？

Answer 1

您应该能够像在常规 Python 版本中一样安装它。 PyPy 已经包含在 Biopython 的集成测试中。

使用 virtualenvwrapper 的示例:

$ mkvirtualenv -p /usr/bin/pypy biopy
$ workon biopy
$ cd biopython  # or wherever your biopython directory is
$ python setup.py install
$ python -c 'import Bio'

如果您没有看到上述命令的任何错误消息，那么它应该可以正常工作。