python - 使用 pandas 排序每两行输出的结果

Question

我正在使用的程序输出了一个制表符分隔的文件，如下所示:

marker A B C
Bin_1  1 2 1
marker C G H B T
Bin_2  3 1 1 1 2
marker B H T Z Y A C
Bin_3  1 1 2 1 3 4 5

我想修复它，让它看起来像这样:

marker A B C G H T Y Z
Bin_1  1 2 1 0 0 0 0 0
Bin_2  0 1 3 1 1 1 0 0
Bin_3  4 1 5 0 1 2 3 1

这是我目前的情况

import pandas as pd 
from collections import OrderedDict
df = pd.read_csv('markers.txt',header=None,sep='\t')
x = map(list,df.values)
list_of_dicts = []
s = 0 
e =1
g = len(x)+1
while e < g:
    new_dict = OrderedDict(zip(x[s],x[e]))
    list_of_dicts.append(new_dict)
    s += 2
    e += 2

最初我将它们转换为字典，然后打算进行某种计数并重新创建数据框，但这似乎需要花费大量时间和内存来完成看似简单的任务。关于更好的方法来解决这个问题有什么建议吗？

Answer 1

lines = [str.strip(l).split() for l in open('markers.txt').readlines()]
dicts = {b[0]: pd.Series(dict(zip(m[1:], b[1:])))
         for m, b in zip(lines[::2], lines[1::2])}
pd.concat(dicts).unstack(fill_value=0)

       A  B  C  G  H  T  Y  Z
Bin_1  1  2  1  0  0  0  0  0
Bin_2  0  1  3  1  1  2  0  0
Bin_3  4  1  5  0  1  2  3  1