Python:跟踪文本文件中的当前列

Question

这里是 Python 初学者。我正在逐列迭代一个文本文件。

for line in Input:
    line = line.rstrip() 
    fields = line.split("\t")   
    for col in fields[5:]:

当我遍历列时，如何跟踪我所在的列？我想在输出中打印当前相关的列，这样当我得到结果时我就知道结果指的是哪一列。似乎有一个明显的答案，但我不知道!

在此先感谢您的帮助。我发现这里的人们乐于助人。

一些输入/输出示例:

输入文件中的行:

 chr20   1032    .       A     1/1 1/1 1/1 0/1 0/0
 chr20   1326    .       T     1/1 1/1 1/1 0/1 0/0
 chr20   1388    .       C     0/0 1/1 ./. 0/1 0/0

然后我浏览这些行，查看第 5 列，例如 1/1、1/1、0/0 并计算一些输出统计数据。我的输出文件包含使用第 5 列计算的每 x 行的统计信息。我希望我的输出文件还包括第 6 列、第 7 列等的结果，并且输出文件中的行告诉我数据是从哪一列计算的。本质上是为了节省我为每一列单独重新运行脚本的时间。

输出示例:

5   chr1    230344070   231345012   1000942 200720  66560   119841  7160    5.63775088385   94.3622491161
5   chr1    231345012   232345029   1000017 167920  55040   106160  3360    3.06793279766   96.9320672023
5   chr1    232345029   233345195   1000166 179280  64841   96079   9180    8.72134449311   91.2786555069

这里的第一列是指它是根据第 5 列中的值计算的事实

for index, col in enumerate(fields[5:]):

最好的，

鲁巴尔

Answer 1

你可以试试这样的东西

for i,col in enumerate(fields[5:], 5):
    ....

enumerate()将为您生成一个索引值，默认情况下它以 0 开头，除非将起始值指定为 enumerate() 的第二个参数，如上所示为 5。

变量 i 将从值 5 开始，并允许您跟踪您正在处理的当前列和 col(和以前一样)该字段的值专栏。

或者，为了方便和更容易修改，您可以使用变量:

start_col = 5
for i,col in enumerate(fields[start_col:], start_col):
    ....

--- 更新回复下面的评论:

我仍然不太确定我是否理解您的评论，但是如果您发布的循环在一个更大的循环中，您可以像这样跟踪您当前的专栏:

cur_column = 5
for line in Input:
    line = line.rstrip() 
    fields = line.split("\t")   
    for col in fields[cur_colum:]:
       ...
       ...

cur_column += 1 # done processing current column, increment value to next column

如果您的代码太大而无法发布，发布一些简单的输入/输出示例会有所帮助。如果没有更多信息，很难真正知道如何提供帮助。我希望这对您有所帮助。