python - 在 h5py 中输入数字数组列表

Question

我试图使用 h5py 将数字数组列表输入到 HDF5 文件中。考虑例如:

f = h5py.File('tester.hdf5','w')
b = [[1,2][1,2,3]]

这会引发错误。

TypeError: Object dtype dtype('O') has no native HDF5 equivalent

所以我假设 HDF5 不支持这个。

就像您可以使用特殊数据类型存储字符串列表一样，是否也有一种方法可以存储数字数组列表。

H5py store list of list of strings

如果没有，还有什么其他合适的方法来存储这样的列表，我以后可以从内存中访问它。

提前感谢您的帮助

Answer 1

您可以将您的列表列表拆分为单独的数据集并单独存储它们:

import h5py
my_list = [[1,2],[1,2,3]]
f = h5py.File('tester.hdf5','w')
grp=f.create_group('list_of_lists')
for i,list in enumerate(my_list):
    grp.create_dataset(str(i),data=list)

这样做之后，您可以像以前一样对数据集进行切片，但有一点变化:

In[1]: grp[str(0)][:].tolist()
Out[1]: [1, 2]
In[2]: grp[str(1)][:].tolist()
Out[2]: [1, 2, 3]