r - 如何检验所有样本组合是否存在显着差异？

Question

我正在分析 R 中包含 9 个绘图的数据集，并想将它们相互比较。我的响应变量不是正态分布的。

现在我的问题:

有 9+8+7+...+2+1=45 对组合要测试。 R 可以自动执行此操作吗？如果是，如何？我希望输出的是一个盒须图，x 轴是我的 9 个图，y 轴是响应变量，图上方的小写字母表示显着差异。

提前致谢!

Answer 1

这应该让你开始:

#some data
x <- rlnorm(100, mean=1:4)
DF <- data.frame(x=x, g=c("a", "b", "c", "d"), stringsAsFactors=FALSE)

#pairwise Mann-Whitney-U-test
pairwise.wilcox.test(DF$x, DF$g, p.adjust.method = "bonferroni")

#   Pairwise comparisons using Wilcoxon rank sum test 
#
#data:  DF$x and DF$g 
#
#  a       b       c     
#b 0.0016  -       -     
#c 6.3e-09 0.0020  -     
#d 1.9e-13 2.0e-08 0.1823
#
#P value adjustment method: bonferroni