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我有 2 个字符串要比较。问题是我不知道如何同时对两者进行切片,然后在每个切片上运行比较代码。下面是我试图通过在 for 循环中使用 for 循环(每个字符串一个)来运行的代码) 没有出现任何错误,但只有第一个字符串被迭代切片并打印到屏幕上。第二次尝试是将 2 个 for 循环合并在一起,但是出现了提供的错误消息,它清楚地解释了它失败的原因,但是我不知道解决该错误的方法。
for循环中for循环的代码
for i in range(8, len(seq1)):
seq1i = seq1[0:i]
print seq1i
for i in range(8,len(seq2)):
seq2i = seq2[0:i]
print seq2i
for c1, c2 in zip(seq1i, seq2i):
if c1 == c2:
counter += 1
else:
break
print "String share the longest common prefix of length %d: %s" % (counter, seq1[:counter])
if counter >= 8:
print " Match found, match length %d" % counter
尝试合并 for 循环:
for i1,i2 in range(8,len(seq1, seq2)):
for c1, c2 in zip(seq1i, seq2i):
if c1 == c2:
counter += 1
else:
break
print "String share the longest common prefix of length %d: %s" % (counter, seq1[:counter])
if counter >= 8:
print " Match found, match length %d" % counter
这导致了错误:
TypeError Traceback (most recent call last)
<ipython-input-26-9c4822069792> in <module>()
----> 1 for i1,i2 in range(8,len(seq1, seq2)):
2 for c1, c2 in zip(seq1i, seq2i):
3 if c1 == c2:
4 counter += 1
5 else:
TypeError: len() takes exactly one argument (2 given)
我认为必须有一种方法,其中每次对字符串进行迭代切片都会发生,并且在进行匹配(如果 c1 == c2)代码时可以运行。
想要的输出是:
如果 seq1 和 seq2:
seq1 = 'ATCGATCGATCGAAAA'
seq2 = 'ATCGATCGATCCCCCC'
A
A
AT
AT
ATC
ATC
ATCG
ATCG
ATCGA
ATCGA
ATCGAT
ATCGAT
ATCGATC
ATCGATC
ATCGATCG
ATCGATCG
ATCGATCGA
ATCGATCGA
ATCGATCGAT
ATCGATCGAT
ATCGATCGATC
ATCGATCGATC
String share the longest common prefix of length 10:ATCGATCGATC
最佳答案
我敢肯定有使用高级切片和/或 itertools 的更好的解决方案,但老实说,我认为简单的循环是这里最简单的事情。
for i, c in enumerate(seq1):
try:
if c != seq2[i]:
break
print seq1[:i + 1] + '\n' + seq1[:i + 1]
except IndexError:
break
print 'Longest common prefix %s of length %d' % (seq1[:i], i)
关于python - 如何使 for 循环使用 2 个字符串?,我们在Stack Overflow上找到一个类似的问题: https://stackoverflow.com/questions/23895795/
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