python - Matplotlib PDF 后端慢？

Question

我正在使用 matplotlib 将一千个绘图写入 PDF。我已经优化了绘图代码，即。重用图形/轴/线并仅更改 y 数据。

大部分剩余时间都花在了 save_figure 上。

相比之下，R 将绘图输出为 PDF 的速度似乎快了大约 2 倍。在 R 中绘制所有零数据似乎更快，而在 Python 中它们的速度相同。

我设置了 pdf.compression = 0，这有一点改进。

尝试对数据进行栅格化，这对绘图速度没有影响(尽管它使用了大量 RAM)。

还有什么我可以尝试使用 PDF 后端来加速 matplotlib 的，或者是否有任何我应该考虑的替代后端？我想打败 R。

谢谢!

Answer 1

必须尝试pyreport来自 Gael Varoquaux？您在脚本中调用它，然后它会收集对 pylab.show() 的所有调用，为每个调用制作一个 png，然后从中创建一个 PDF。

它最终使用了 Latex，因此您将需要它。但我希望这可能会更快，因为 PDF 的创建委托(delegate)给了 Latex。