python - 将对象的实例附加到列表仅适用于耗时的深度复制，我该如何更改它？

Question

我有一个来自 pymzml 包的 pymzml.run.Reader 类。这是一个生成器对象，当循环遍历它时，它会产生 Spectrum 类的实例(也来自 pymzml 包)。我正在相互比较不同的实例。因为pymzml.run.Reader是一个生成器对象，循环遍历后就不能再使用了，所以我把它们保存在一个列表中，以便稍后比较。

但是，当我将它们保存在一个列表中，然后遍历打印光谱 ID 的列表时，它显示它只保存了最后一个光谱。澄清一下:

import pymzml

def test(msrun):
    for spectrum in msrun:
        print spectrum['id']            
        spectrumList.append(spectrum)
    print '-'*20
    for i in spectrumList:
        print i['id']

msrun = pymzml.run.Reader(r'JG_Ti02-C1-1_C2-01A_file1.aligned.mzML')

给出:

1
2
3
4
5
--------------------
5
5 
5 
5
5

pymzml 有一个 deRef() 函数，可以对光谱进行深层复制，因此以下内容可以正常工作:

import pymzml

def test(msrun):
    for spectrum in msrun: 
        print spectrum['id']
        spectrumList.append(spectrum.deRef())

msrun = pymzml.run.Reader(r'JG_Ti02-C1-1_C2-01A_file1.aligned.mzML') 

然而，制作深度复制是我试图摆脱我的应用程序的主要瓶颈。如何将频谱实例附加到列表中，以便不仅最后一个频谱被附加多次？

Answer 1

不能只是保存最后一个光谱——您正在做所有正确的事情来将每个对象保存到列表中。

问题是你一遍又一遍地得到同一个对象。

在循环中打印 id(spectrum) 以获取其内存地址将显示它是一个重复的对象，其 id 和其他属性已更改。

虽然您不一定需要 copy.deepcopy()，但您确实需要复制一份。尝试 copy.copy()，并查看 Spectrum.decRef() 的源代码以了解它是如何进行复制的。

很可能，您确实需要decRef() 使它们独立——否则，为什么该类会提供一种特殊的方法？