python - 我可以在 Cython 中静态键入 h5file 数组吗？

Question

我开发了一个库，该库在低级别使用 Cython 来解决二维数组中的流问题。如果这些数组是 numpy 数组，我可以静态键入它们，从而避免 Python 解释器随机访问这些数组的开销。为了处理大到内存无法容纳的数组，我计划使用 pytables 中的 hd5file 数组来代替 numpy，但我不知道是否可以静态键入 CArray。

是否可以在 Cython 中静态键入 hd5file CArrays 以避免随机访问这些数组时 Python 解释器的开销？

Answer 1

如果你使用 h5py 包，你可以在它给你的数据集上使用 numpy.asarray()，然后你有一个更熟悉的 NumPy 数组，你已经懂得应对。

请注意，直到几年前，h5py 有一个与此相关的错误，导致在执行 asarray() 时性能极其缓慢，但已解决，所以请不要如果您要尝试此操作，请不要使用非常旧的版本。