python - 序列输出循环 - python

Question

我一直在努力寻找一种方法，让我的序列在不同的行上打印出序列中的 6 聚体。如此(注意每行的间距):

atgctagtcatc
 tgctag
  gctagt
   ctagtc
    tagtca
     etc

到目前为止，我已经能够得到我的字符串序列，如下所示:

from Bio import SeqIO
record = SeqIO.read(open("testSeq.fasta"), "fasta")
sequence = str(record.seq)

但是，我似乎想出打印 6 聚体的唯一方法是:

print sequence 
print sequence[0:5]
print "", sequence[1:6]
print "", "", sequence[2:7]
print "", "", "", sequence [3:8]
etc

我觉得应该有一种更简单的方法来做到这一点。我试过这个，但它似乎不起作用:

x = 0
y = 6
for sequence in sequence[x:y]
    print sequence
    x = x + 1
    y = y + 1

如果您对我应该如何尝试完成这项任务提出任何意见，我们将不胜感激。我现在才使用 python 几天，如果我的问题看起来很简单，我很抱歉。

谢谢!!

Answer 1

这应该有效:

width = 6
for i in range(len(sequence) - width):
    print " " * i + sequence[i:i+width]