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我想画箱形图,但我没有原始数据,但在 Pandas DataFrame 中有聚合结果。
是否仍然可以从聚合结果中绘制箱线图?
如果不是,我能得到的最接近的图是什么,用于绘制最小值、最大值、平均值、中值、标准差等。我知道我可以使用折线图绘制它们,但我需要对箱线图进行分组/聚集。
这是我的数据,缺少绘图部分。请帮忙。谢谢
import matplotlib.pyplot as plt
import numpy as np
import pandas as pd
df = pd.DataFrame({
'group' : ['Tick Tick Tick', 'Tock Tock Tock', 'Tock Tock Tock', 'Tick Tick Tick']*3, # , ['Tock Tock Tock', 'Tick Tick Tick']*6,
'person':[x*5 for x in list('ABC')]*4,
'Median':np.random.randn(12),
'StdDev':np.random.randn(12)
})
df["Average"]=df["Median"]*1.1
df["Minimum"]=df["Median"]*0.5
df["Maximum"]=df["Median"]*1.6
df["90%"]=df["Maximum"]*0.9
df["95%"]=df["Maximum"]*0.95
df["99%"]=df["Maximum"]*0.99
df
更新,
我现在离得到我的结果又近了一步——我刚刚发现这个特征是 available since matplotlib 1.4 ,我正在使用 matplotlib 1.5,我测试了它和 proved that it is working for me .
问题是我不知道它为什么有效,也不知道如何调整我上面的代码来使用这样的新功能。我将在下面重新发布我的工作代码,希望有人能理解并将两个和两个放在一起。
我有中位数、平均值、最小值、90%、95%、99%、最大值和标准差,我希望将它们全部绘制成图表。我查看了以下代码的 logstats
的数据结构,在 for stats, label in zip(logstats, list('ABCD'))
之后,以及发现它的字段是:
[{'cihi': 4.2781254505311281,
'cilo': 1.6164348064249057,
'fliers': array([ 19.69118642, 19.01171604]),
'iqr': 5.1561885723613567,
'label': 'A',
'mean': 4.9486856766955922,
'med': 2.9472801284780168,
'q1': 1.7655440553898782,
'q3': 6.9217326277512345,
'whishi': 12.576334012545718,
'whislo': 0.24252084924003742},
{'cihi': 4.3186289184254107,
'cilo': 1.9963715983778565,
...
所以,从这里
和 bxp
文档,我将按如下方式映射我的数据:
要映射它们,我将执行 SELECT Minimum AS whislo, [90%] AS mean, [95%] as q3, [99%] as whishi
...这是最终结果:
raw_data = {'label': ['Label_01 Init', 'Label_02', 'Label_03', 'Label_04', 'Label_05', 'Label_06', 'Label_07', 'Label_08', 'Label_99'], 'whislo': [0.17999999999999999, 2.0299999999999998, 4.0800000000000001, 2.0899999999999999, 2.3300000000000001, 2.3799999999999999, 1.97, 2.6499999999999999, 0.089999999999999997], 'q3': [0.5, 4.9699999999999998, 11.77, 5.71, 12.460000000000001, 11.859999999999999, 13.84, 16.969999999999999, 0.29999999999999999], 'mean': [0.40000000000000002, 4.1299999999999999, 10.619999999999999, 5.0999999999999996, 10.24, 9.0700000000000003, 11.960000000000001, 15.15, 0.26000000000000001], 'whishi': [1.76, 7.6399999999999997, 20.039999999999999, 6.6699999999999999, 22.460000000000001, 21.66, 16.629999999999999, 19.690000000000001, 1.1799999999999999], 'q1': [0.28000000000000003, 2.96, 7.6100000000000003, 3.46, 5.8099999999999996, 5.4400000000000004, 6.6299999999999999, 8.9900000000000002, 0.16], 'fliers': [5.5, 17.129999999999999, 32.890000000000001, 7.9100000000000001, 32.829999999999998, 70.680000000000007, 24.699999999999999, 32.240000000000002, 3.3500000000000001]}
df = pd.DataFrame(raw_data, columns = ['label', 'whislo', 'q1', 'mean', 'q3', 'whishi', 'fliers'])
现在要挑战的是如何在具有多级分组的箱形图中呈现我的上述数据框。如果多级分组太困难,让我们先从 pd 数据帧开始绘图,因为我的 pd
数据帧与所需的 np
数组具有相同的字段。所以我尝试了,
fig, ax = plt.subplots()
ax.bxp(df.as_matrix(), showmeans=True, showfliers=True, vert=False)
但是我得到了
...\Anaconda3\lib\site-packages\matplotlib\axes\_axes.py in bxp(self, bxpstats, positions, widths, vert, patch_artist, shownotches, showmeans, showcaps, showbox, showfliers, boxprops, whiskerprops, flierprops, medianprops, capprops, meanprops, meanline, manage_xticks)
3601 for pos, width, stats in zip(positions, widths, bxpstats):
3602 # try to find a new label
-> 3603 datalabels.append(stats.get('label', pos))
3604 # fliers coords
3605 flier_x = np.ones(len(stats['fliers'])) * pos
AttributeError: 'numpy.ndarray' object has no attribute 'get'
如果我使用 ax.bxp(df.to_records(), ...
,那么我会得到 AttributeError: 'record' object has no attribute 'get'
.
好吧,我终于让它工作了,从 pd 数据帧绘图,但不是多级分组,像这样:
df['fliers']=''
fig, ax = plt.subplots()
ax.bxp(df.to_dict('records'), showmeans=True, meanline=True, showfliers=False, vert=False) # shownotches=True,
plt.show()
注意我上面的数据缺少med
字段,你可以添加正确的,或者使用df['med']=df['q1']*1.2
让它发挥作用。
import matplotlib
import matplotlib.pyplot as plt
import numpy as np
import pandas as pd
def test_bxp_with_ylabels():
np.random.seed(937)
logstats = matplotlib.cbook.boxplot_stats(
np.random.lognormal(mean=1.25, sigma=1., size=(37,4))
)
print(logstats)
for stats, label in zip(logstats, list('ABCD')):
stats['label'] = label
fig, ax = plt.subplots()
ax.set_xscale('log')
ax.bxp(logstats, vert=False)
test_bxp_with_ylabels()
最佳答案
在等待澄清您的 df 时,与:
dic = [{'cihi': 4.2781254505311281,
'cilo': 1.6164348064249057,
'fliers': array([ 19.69118642, 19.01171604]),
'iqr': 5.1561885723613567,
'mean': 4.9486856766955922,
'med': 2.9472801284780168,
'q1': 1.7655440553898782,
'q3': 6.9217326277512345,
'whishi': 12.576334012545718,
'whislo': 0.24252084924003742}]
以及您的数据应如何映射:
来自 bxp
文档:
Required keys are:
- ``med``: The median (scalar float).
- ``q1``: The first quartile (25th percentile) (scalar
float).
- ``q3``: The first quartile (50th percentile) (scalar
float). # Here I guess it's rather : the 3rd quartile (75th percentile)
- ``whislo``: Lower bound of the lower whisker (scalar
float).
- ``whishi``: Upper bound of the upper whisker (scalar
float).
Optional keys are:
- ``mean``: The mean (scalar float). Needed if
``showmeans=True``.
- ``fliers``: Data beyond the whiskers (sequence of floats).
Needed if ``showfliers=True``.
- ``cilo`` & ``cihi``: Lower and upper confidence intervals
about the median. Needed if ``shownotches=True``.
然后,你只需要做:
fig, ax = plt.subplots(1,1)
ax.bxp([dic], showmeans=True)
所以你只需要找到一种方法来构建你的dic
。请注意,它不会绘制您的 std
并且对于晶须,您需要选择它们是达到 90%、95% 还是 99%,但您不能拥有所有值。在这种情况下,您需要在之后使用 plt.hlines()
之类的东西添加它们。
HTH
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