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python - Seaborn clustermap : what's the main argument, 观测值或距离?

转载 作者:行者123 更新时间:2023-11-28 17:30:35 26 4
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seaborn clustermap数据 参数是什么? .

是否需要一个矩阵,其中每个单元格是原始矩阵的向量与观测值之间的距离?或者 clustermap 自己计算距离,所以我需要通过观察矩阵?

在第一种情况下,参数 metric 有什么用?是否有指示已使用哪个度量来计算距离?

最佳答案

显然 - 查看您链接的页面上的“示例” - 它需要一个数据表和一个用于计算距离的度量。

正如 clustermap 的文档明确指出的那样,它使用 scipy.spatial.distance.pdist计算成对距离。

我没有看到使用预先计算的距离矩阵的选项,尽管可以传递可以执行矩阵查找的自定义函数。

关于python - Seaborn clustermap : what's the main argument, 观测值或距离?,我们在Stack Overflow上找到一个类似的问题: https://stackoverflow.com/questions/34655955/

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