- html - 出于某种原因,IE8 对我的 Sass 文件中继承的 html5 CSS 不友好?
- JMeter 在响应断言中使用 span 标签的问题
- html - 在 :hover and :active? 上具有不同效果的 CSS 动画
- html - 相对于居中的 html 内容固定的 CSS 重复背景?
我在查询规范很多的时候经常遇到一个问题,如何加快这个过程?
基本上我真的经常使用apply
函数来获得结果,但很多时候,计算需要很长的时间。
是否有好的做法来找到如何优化 Pandas 代码?
这是一个示例,我有一个 DataFrame 表示包含 3 列的聊天交换:
timestamp
:消息的时间戳sender_id
: 发件人idreceiver_id
: 接收方id目标是找到在不到 5 分钟内得到响应的消息的比例。这是我的代码:
import pandas as pd
import numpy as np
import datetime
size_df = 30000
np.random.seed(42)
data = {
'timestamp': pd.date_range('2019-03-01', periods=size_df, freq='30S').astype(int),
'sender_id': np.random.randint(5, size=size_df),
'receiver_id': np.random.randint(5, size=size_df)
}
dataframe = pd.DataFrame(data)
这是 DataFrame 的样子:
print(dataframe.head().to_string())
timestamp sender_id receiver_id
0 1551398400000000000 4 2
1 1551398430000000000 3 2
2 1551398460000000000 1 1
3 1551398490000000000 4 3
4 1551398520000000000 4 3
apply使用的函数:
def apply_find_next_answer_within_5_min(row):
"""
Find the index of the next response in a range of 5 minutes
"""
[timestamp, sender, receiver] = row
## find the next responses from receiver to sender in the next 5 minutes
next_responses = df_groups.get_group((receiver, sender))["timestamp"]\
.loc[lambda x: (x > timestamp) & (x < timestamp + 5 * 60 * 1000 * 1000 * 1000)]
## if there is no next responses just return NaN
if not next_responses.size:
return np.nan
## find the next messages from sender to receiver in the next 5 minutes
next_messages = df_groups.get_group((sender, receiver))["timestamp"]\
.loc[lambda x: (x > timestamp) & (x < timestamp + 5 * 60 * 1000 * 1000 * 1000)]
## if the first next message is before next response return nan else return index next reponse
return np.nan if next_messages.size and next_messages.iloc[0] < next_responses.iloc[0] else next_responses.index[0]
%%timeit
df_messages = dataframe.copy()
## create a dataframe to easily find messages from a specific sender and receiver, speed up the querying process for these messages.
df_groups = df_messages.groupby(["sender_id", "receiver_id"])
df_messages["next_message"] = df_messages.apply(lambda row: apply_find_next_answer_within_5_min(row), axis=1)
输出timeit
:
42 s ± 2.16 s per loop (mean ± std. dev. of 7 runs, 1 loop each)
因此,为 30 000 行
DataFrame 应用该函数需要 42 秒
。我认为它很长,但我没有找到提高效率的方法。通过使用对发送方和接收方进行分组的中间数据帧而不是在应用函数中查询大数据帧,我已经获得了 40 秒
。
这将是这个特定问题的响应:
1 - df_messages.next_message[lambda x: pd.isnull(x)].size / df_messages.next_message.size
0.2753
那么在这种情况下,您如何找到更有效的计算方法呢?有什么技巧可以考虑吗?
在这个例子中,我认为不可能一直使用矢量化,但也许通过使用更多的组,可以更快?
最佳答案
您可以尝试对您的数据框进行分组
groups = dataframe.reset_index()\ #I reset_index for later to get the value
.groupby([ frozenset([se, re]) #need frosenset to allow the groupby
for se, re in dataframe[['sender_id', 'receiver_id']].values])
现在您可以创建符合条件的 bool 掩码
mask_1 = ( # within a group, check if the following message is sent from the other one
(groups.sender_id.diff(-1).ne(0)
# or if the person talks to oneself
| dataframe.sender_id.eq(dataframe.receiver_id) )
# and check if the following message is within 5 min
& groups.timestamp.diff(-1).gt(-5*60*1000*1000*1000))
现在使用掩码查找索引创建列并在索引上移动:
df_messages.loc[mask_1, 'next_message'] = groups['index'].shift(-1)[mask_1]
你喜欢你的方法并且应该更快:
print (df_messages.head(20))
timestamp sender_id receiver_id next_message
0 1551398400000000000 3 1 NaN
1 1551398430000000000 4 1 NaN
2 1551398460000000000 2 3 NaN
3 1551398490000000000 4 1 NaN
4 1551398520000000000 4 3 NaN
5 1551398550000000000 1 1 NaN
6 1551398580000000000 2 3 10.0
7 1551398610000000000 2 4 NaN
8 1551398640000000000 2 4 NaN
9 1551398670000000000 4 1 NaN
10 1551398700000000000 3 2 NaN
11 1551398730000000000 2 4 NaN
12 1551398760000000000 4 0 18.0
13 1551398790000000000 1 0 NaN
14 1551398820000000000 3 3 16.0
15 1551398850000000000 1 2 NaN
16 1551398880000000000 3 3 NaN
17 1551398910000000000 4 1 NaN
18 1551398940000000000 0 4 NaN
19 1551398970000000000 3 2 NaN
关于python - 当有多个规范时,在 Pandas 中优化计算的最佳做法是什么?,我们在Stack Overflow上找到一个类似的问题: https://stackoverflow.com/questions/57467204/
pandas.crosstab 和 Pandas 数据透视表似乎都提供了完全相同的功能。有什么不同吗? 最佳答案 pivot_table没有 normalize争论,不幸的是。 在 crosstab
我能找到的最接近的答案似乎太复杂:How I can create an interval column in pandas? 如果我有一个如下所示的 pandas 数据框: +-------+ |
这是我用来将某一行的一列值移动到同一行的另一列的当前代码: #Move 2014/15 column ValB to column ValA df.loc[(df.Survey_year == 201
我有一个以下格式的 Pandas 数据框: df = pd.DataFrame({'a' : [0,1,2,3,4,5,6], 'b' : [-0.5, 0.0, 1.0, 1.2, 1.4,
所以我有这两个数据框,我想得到一个新的数据框,它由两个数据框的行的克罗内克积组成。正确的做法是什么? 举个例子:数据框1 c1 c2 0 10 100 1 11 110 2 12
TL;DR:在 pandas 中,如何绘制条形图以使其 x 轴刻度标签看起来像折线图? 我制作了一个间隔均匀的时间序列(每天一个项目),并且可以像这样很好地绘制它: intensity[350:450
我有以下两个时间列,“Time1”和“Time2”。我必须计算 Pandas 中的“差异”列,即 (Time2-Time1): Time1 Time2
从这个 df 去的正确方法是什么: >>> df=pd.DataFrame({'a':['jeff','bob','jill'], 'b':['bob','jeff','mike']}) >>> df
我想按周从 Pandas 框架中的列中累积计算唯一值。例如,假设我有这样的数据: df = pd.DataFrame({'user_id':[1,1,1,2,2,2],'week':[1,1,2,1,
数据透视表的表示形式看起来不像我在寻找的东西,更具体地说,结果行的顺序。 我不知道如何以正确的方式进行更改。 df示例: test_df = pd.DataFrame({'name':['name_1
我有一个数据框,如下所示。 Category Actual Predicted 1 1 1 1 0
我有一个 df,如下所示。 df: ID open_date limit 1 2020-06-03 100 1 2020-06-23 500
我有一个 df ,其中包含与唯一值关联的各种字符串。对于这些唯一值,我想删除不等于单独列表的行,最后一行除外。 下面使用 Label 中的各种字符串值与 Item 相关联.所以对于每个唯一的 Item
考虑以下具有相同名称的列的数据框(显然,这确实发生了,目前我有一个像这样的数据集!:() >>> df = pd.DataFrame({"a":range(10,15),"b":range(5,10)
我在 Pandas 中有一个 DF,它看起来像: Letters Numbers A 1 A 3 A 2 A 1 B 1 B 2
如何减去两列之间的时间并将其转换为分钟 Date Time Ordered Time Delivered 0 1/11/19 9:25:00 am 10:58:00 am
我试图理解 pandas 中的下/上百分位数计算,但有点困惑。这是它的示例代码和输出。 test = pd.Series([7, 15, 36, 39, 40, 41]) test.describe(
我有一个多索引数据框,如下所示: TQ bought HT Detailed Instru
我需要从包含值“低”,“中”或“高”的数据框列创建直方图。当我尝试执行通常的df.column.hist()时,出现以下错误。 ex3.Severity.value_counts() Out[85]:
我试图根据另一列的长度对一列进行子串,但结果集是 NaN .我究竟做错了什么? import pandas as pd df = pd.DataFrame([['abcdefghi','xyz'],
我是一名优秀的程序员,十分优秀!