python - numpy 初学者 : writing an array using numpy. savetxt

Question

我有一个 numpy 直方图，我想将其输出为制表符分隔的文本文件。我的代码如下:

targethist = np.histogram(targetlist, bins=ilist)
print targethist
np.savetxt('ChrI_dens.txt',targethist,delimiter='\t')

targetlist 和 ilist 是整数的长列表。我得到以下输出:

(array([0, 0, 0, ..., 0, 0, 0]), array([ 1, 10000, 20000, ..., 15060000, 15070000, 15072422])) Traceback (most recent call last): File "target_dens_np.py", line 62, in np.savetxt('ChrI_dens.txt',targethist,delimiter='\t') File "/Library/Frameworks/Python.framework/Versions/7.3/lib/python2.7/site-packages/numpy/lib/npyio.py", line 979, in savetxt fh.write(asbytes(format % tuple(row) + newline)) TypeError: float argument required, not numpy.ndarray

似乎直方图数组已经创建，但我在 np.savetxt() 行中做错了。我已阅读文档，但不明白为什么此函数中的任何参数都需要 float 。我哪里出错了？

Answer 1

我认为问题在于 savetxt 的第二个参数必须是“类数组”。您的输入不是“类似数组”的。例如

print (len(targethist[0]))
print (len(targethist[1]))

注意到长度不一样了吗？如果长度相同，numpy 可以将其转换为单个二维数组，一切都会好起来的，但它无法进行转换，因此失败。

这行得通

np.savetxt('stuff.dat',(targethist[0],targethist[1][1:]),delimiter='\t')

但我截断了您的数据 ;)。你需要决定你想做什么来解决这个问题。

我必须承认，这里的错误信息非常隐蔽。