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我已经成功地创建了一个标量值属性,它的值是一个可变长度的 const char* 数组。但是我不明白如何读取这个属性!
这是我用来创建属性的代码:
void create_attribute_with_vector_of_strings_as_value()
{
using namespace H5;
// Create some test strings.
std::vector<std::string> strings;
for (int iii = 0; iii < 10; iii++)
{
strings.push_back("this is " + boost::lexical_cast<std::string>(iii));
}
// Part 1: grab pointers to the chars
std::vector<const char*> chars;
for (auto si = strings.begin(); si != strings.end(); ++si)
{
std::string &s = (*si);
chars.push_back(s.c_str());
}
BOOST_TEST_MESSAGE("Size of char* array is: " << chars.size());
// Part 2: create the variable length type
hvl_t hdf_buffer;
hdf_buffer.p = chars.data();
hdf_buffer.len = chars.size();
// Part 3: create the type
auto s_type = H5::StrType(H5::PredType::C_S1, H5T_VARIABLE);
auto svec_type = H5::VarLenType(&s_type);
try
{
// Open an existing file and dataset.
H5File file(m_file_name.c_str(), H5F_ACC_RDWR);
// Part 4: write the output to a scalar attribute
DataSet dataset = file.openDataSet(m_dataset_name.c_str());
std::string filter_names = "multi_filters";
Attribute attribute = dataset.createAttribute( filter_names.c_str(), svec_type, H5S_SCALAR);
attribute.write(svec_type, &hdf_buffer);
file.close();
}
这是从 h5dump 中看到的具有属性的数据集:
HDF5 "d:\tmp\hdf5_tutorial\h5tutr_dset.h5" {
GROUP "/" {
DATASET "dset" {
DATATYPE H5T_STD_I32BE
DATASPACE SIMPLE { ( 4, 6 ) / ( 4, 6 ) }
DATA {
(0,0): 1, 7, 13, 19, 25, 31,
(1,0): 2, 8, 14, 20, 26, 32,
(2,0): 3, 9, 15, 21, 27, 33,
(3,0): 4, 10, 16, 22, 28, 34
}
ATTRIBUTE "multi_filters" {
DATATYPE H5T_VLEN { H5T_STRING {
STRSIZE H5T_VARIABLE;
STRPAD H5T_STR_NULLTERM;
CSET H5T_CSET_ASCII;
CTYPE H5T_C_S1;
}}
DATASPACE SCALAR
DATA {
(0): ("this is 0", "this is 1", "this is 2", "this is 3", "this is 4", "this is 5", "this is 6", "this is 7", "this is 8", "this is 9")
}
}
}
}
}
我不明白如何读取这些数据。到目前为止我试验过的代码如下。它可以编译,但是我已经将数组大小硬连接到已知长度并且可变长度 cstrings 是空的?有人对我哪里出错有任何建议吗?具体来说,如何查询 const char* 数组的长度以及如何读取数组中包含的实际 const char* cstring?
void read_attribute_with_vector_of_strings_as_value()
{
using namespace H5;
std::vector<std::string> strings;
try
{
// Open an existing file and dataset readonly
H5File file(m_file_name.c_str(), H5F_ACC_RDONLY);
// Part 4: Open the dataset
DataSet dataset = file.openDataSet(m_dataset_name.c_str());
// Atribute_name
std::string filter_names = "multi_filters";
Attribute attribute = dataset.openAttribute(filter_names.c_str());
size_t sz = attribute.getInMemDataSize();
size_t sz_1 = attribute.getStorageSize();
auto t1 = attribute.getDataType();
VarLenType t2 = attribute.getVarLenType();
H5T_class_t type_class = attribute.getTypeClass();
if (type_class == H5T_STRING)
BOOST_TEST_MESSAGE("H5T_STRING");
int length = 10;
std::vector<char*> tmp_vec(length);
auto s_type = H5::StrType(H5::PredType::C_S1, H5T_VARIABLE);
auto svec_type = H5::VarLenType(&s_type);
hvl_t hdf_buffer;
hdf_buffer.p = tmp_vec.data();
hdf_buffer.len = length;
attribute.read(svec_type, &hdf_buffer);
//attribute.read(s_type, &hdf_buffer);
//attribute.read(tmp_vec.data(), s_type);
for(size_t x = 0; x < tmp_vec.size(); ++x)
{
fprintf(stdout, "GOT STRING [%s]\n", tmp_vec[x] );
strings[x] = tmp_vec[x];
}
file.close();
}
最佳答案
如果您不需要使用特定技术来实现您的想法,您可以考虑 HDFql ( http://www.hdfql.com ),这是一种可以轻松管理 HDF 文件的高级语言(想想 SQL)。这样,您就可以从操作您描述的 HDF 文件的所有低级细节中解脱出来。在 C++ 中使用 HDFql,读取可变长度 char 的数组是这样完成的:
// include HDFql C++ header file (make sure it can be found by the C++ compiler)
#include <iostream>
#include "HDFql.hpp"
int main(int argc, char *argv[])
{
// create an HDF file named "example.h5" and use (i.e. open) it
HDFql::execute("CREATE AND USE FILE example.h5");
// create an attribute named "multi_filters" of type varchar of one dimension (size 5)
HDFql::execute("CREATE ATTRIBUTE multi_filters AS VARCHAR(5)");
// insert (i.e. write) values "Red", "Green", "Blue", "Orange" and "Yellow" into attribute "multi_filters"
HDFql::execute("INSERT INTO multi_filters VALUES(Red, Green, Blue, Orange, Yellow)");
// select (i.e. read) attribute "multi_filters" into HDFql default cursor
HDFql::execute("SELECT FROM multi_filters");
// display content of HDFql default cursor
while(HDFql::cursorNext() == HDFql::Success)
{
std::cout << "Color " << HDFql::cursorGetChar() << " has a size of " << HDFql::cursorGetSize() << std::endl;
}
return 0;
}
关于c++ - 如何读取值为可变长度 char* 数组(即 c_strings?)的 HDF5 标量属性,我们在Stack Overflow上找到一个类似的问题: https://stackoverflow.com/questions/40731574/
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