linux - 缩短我的数据标签

Question

所以，我以这一行为例。这是我的数据的标签:d__细菌|p__Proteobacteria|c__Betaproteobacteria|o__Burkholderiales|f__Alcaligenaceae|g__Advenella

我的数据的所有标签都是这种格式。我想做的就是删除大部分，留下最后一部分 g__Advenella。我很菜鸟而且很匆忙，所以如果你能帮助我，它会节省我很多时间。我已经提取了数据标签并将其保存在文本文件中。

Answer 1

使用 Perl、Sed 或 Awk。

Perl

perl -pe 's/^.*\|([^\|]+)$/\1/' input-file > output-file

SED

sed -r 's/^.*\|([^\|]+)$/\1/' input-file > output-file

AWK

awk 'BEGIN{ FS="|"; } {print $NF}' input-file > output-file

纯 Bash

while read -r line; do
  echo ${line/*|/}
done < input-file > output-file